HVDMreport(rHVDM)
HVDMreport()所属R语言包：rHVDM
generates an HTML report using the input
使用输入生成一个HTML报告
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This method generates report using one of the HVDM outputs (either from the training(), screeening() or fitgene() commands.)
此方法生成报表使用的HVDM输出（无论是从training()，screeening()或fitgene()命令。）
用法----------Usage----------
HVDMreport(HVDM,name)
参数----------Arguments----------
参数：HVDM
a list output either by a training(), screening() or fitgene() command.
1，通过training()，screening()或fitgene()命令列表输出。
参数：name
an optional argument allowing to specify the name of the HTML file (the .HTML extension is added automatically).
一个可选的参数，允许指定的HTML文件（。的HTML扩展名自动添加）的名称。
Details
详情----------Details----------
If the output has been generated by training() or fitgene(), the HTML report contains four sections:
如果输出已生成training()或fitgene()，HTML报告包含四个部分：
1) Functions inputs.
1）函数的输入。
2) Model score.
2）模型的得分。
3) Fitted parameters.
3）拟合参数。
4) Visual comparison of model and data.
4）视觉模型和数据的比较。
In the fitgene() case comparisons with correponding results for genes in the training set are given.
在fitgene()情况基因在训练集correponding结果比较。
If the output has been generated by the screening() command, the HTML report contains the following sections:
如果输出已被screening()命令生成HTML报告包含以下几个部分：
1) Inputs to the preceding training() command.
1）输入到前面的training()命令。
2) Inputs to the screening() command (such as bounds used to classify genes).
2）输入screening()命令（如使用的分类基因的界限）。
3) Results.
3）结果。
4) List of putative targets of the transcription factor under review.
4）审查转录因子的假定目标的名单。
The HTML report is genereated in the current working directory. Graphic files are stored in a subdirectory with a similar name.
HTML报告genereated在当前工作目录。图形文件存储在具有类似名称的子目录。
值----------Value----------
Nothing is returned, but a message indicating the name of the HTML file and its location on the hard drive is given.
没有返回，但一条消息，表明HTML文件的名称和它的硬盘驱动器上的位置。
注意----------Note----------
The HTML report is generated in the working directory.
工作目录中生成HTML报告。
作者（S）----------Author(s)----------
Martino Barenco
参考文献----------References----------
of p53 targets using Hidden Variable Dynamic Modelling. Genome Biology, V7(3), R25.
参见----------See Also----------
training,screening,fitgene
training，screening，fitgene
举例----------Examples----------
data(HVDMexample)
tHVDMp53<-training(eset=fiveGyMAS5,genes=p53traingenes,degrate=0.8,actname="p53")
#HVDMreport(tHVDMp53)[HVDMreport（tHVDMp53）]
#HVDMreport(tHVDMp53, name="p53training")[HVDMreport（tHVDMp53，名称=“p53training”）]
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-26 12:55:14
