R语言 rGADEM包 align-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

align-class(rGADEM)
align-class()所属R语言包：rGADEM

                                        Class "align"
                                         类“调整”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This object contains the individual motifs identified but also the location (seqID and position) of the sites in the original sequence data. It also included the spaced dyad from which the motifs is derived, PWM score p-value cuttoff for the run.
此对象包含个别图案确定，但在原始序列数据的网站的位置（seqID和位置）。它还包括从该图案派生的间隔对子，p值的PWM得分运行cuttoff。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("align", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("align", ...)。


插槽----------Slots----------




seq :Motif identified .
SEQ：主题确定。




chr :Chromosome identified.
CHR：染色体鉴定。




start :Sequence start.
启动：启动序列。




end :Sequence end.
结束：序列的末尾。




strand :Strand position.
钢绞线：钢绞线的位置。




seqID :Sequence identification.
seqID：序列鉴定。




pos osition identification.
POS：位置识别。




pval :p-Value for each identification.
pval的：每个标识的p值。




fastaHeader :Fasta accession.
fastaHeader：FASTA加入。


作者（S）----------Author(s)----------


Arnaud Droit <a href="mailto:arnaud.droit@crchuq.ulaval.ca">arnaud.droit@crchuq.ulaval.ca</a>



参见----------See Also----------

gadem , motif, parameters
gadem，motif，parameters


举例----------Examples----------


showClass("align")

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。