R语言 ReadqPCR包 read.qPCR()函数中文帮助文档(中英文对照)

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read.qPCR(ReadqPCR)
read.qPCR()所属R语言包：ReadqPCR

                                         Read user formatted qPCR data and produce a qPCRBatch
                                         阅读用户格式化qPCR数据，并产生一个qPCRBatch

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Reads RT-qPCR data in format specified in the ReadqPCR vignette and uses the data to populate an object of class "qPCRBatch".
在ReadqPCR暗角指定的格式读取RT-qPCR数据和使用数据来填充类"qPCRBatch"的对象。


用法----------Usage----------


read.qPCR(filename = character(0),
          phenoData = new("AnnotatedDataFrame"),
          notes = "",
          verbose = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：filename
file name (must be formatted as shown in vignette).
文件名（必须格式化在暗角所示）。


参数：phenoData
an AnnotatedDataFrame object, a character of length one, or a data.frame.
AnnotatedDataFrame对象，长度，或characterdata.frame。


参数：notes
notes.
笔记。


参数：verbose
verbosity flag. If true more messages are given to the user on the processing steps
冗长的标志。如果真正的更多的消息提供给用户的处理步骤


Details

详情----------Details----------

Permits the user to read in qPCR Ct value data in a predefined format  (more details on this format in the ReadqPCR package vignette), alongside  phenotypic data and further notes about the data. If phenoData is a data.frame,  it is converted to an AnnotatedDataFrame. If it is NULL then a default object of class AnnotatedDataFrame is created, whose pData is a data.frame with rownames being the names of the samples, and with one column sample with an integer index.  More details on how technical replicates are handled in the ReadqPCR package vignette
允许用户在一个预定义的格式（这种格式的更多细节ReadqPCR包小插曲），以及表型数据和有关数据的进一步说明，在qPCR的CT值数据读取。如果phenoData是1 data.frame，它被转换为一个AnnotatedDataFrame。如果是的话NULL类AnnotatedDataFrame然后默认对象被创建时，其pData是样品名称rownames data.frame，并与一列sample一个整数索引。技术复制出更多的细节处理ReadqPCR包小插曲


值----------Value----------

Object of class "qPCRBatch".
对象类"qPCRBatch"。


作者（S）----------Author(s)----------


James Perkins <a href="mailto:jperkins@biochem.ucl.ac.uk">jperkins@biochem.ucl.ac.uk</a>



参见----------See Also----------

ExpressionSet-class
ExpressionSet-class


举例----------Examples----------


  path <- system.file("exData", package = "ReadqPCR")
  qPCR.example <- file.path(path, "qPCR.example.txt")
  qPCRBatch.qPCR <- read.qPCR(qPCR.example)

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