R语言 RDRToolbox包 LLE()函数中文帮助文档(中英文对照)

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LLE(RDRToolbox)
LLE()所属R语言包：RDRToolbox

                                         Locally Linear Embedding
                                         局部线性嵌入

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Computes the Locally Linear Embedding as introduced in 2000 by Roweis, Saul and Lawrence.
计算由Roweis，扫罗和劳伦斯在2000年推出的局部线性嵌入。


用法----------Usage----------


LLE(data, dim=2, k)



参数----------Arguments----------

参数：data
N x D matrix (N samples, D features)  
为N×D矩阵（N个样本，D功能）


参数：dim
dimension of the target space  
维目标空间


参数：k
number of neighbours  
邻居的数目


Details

详情----------Details----------

Locally Linear Embedding (LLE) preserves local properties of the data by representing each sample in the data by a linear combination of its k nearest neighbours with each neighbour weighted independently. LLE finally chooses the low-dimensional representation that best preserves the weights in the target space. <br> This R version is based on the Matlab implementation by Sam Roweis.
局部线性嵌入（LLE）代表每个样本中的每个邻居加权独立的线性组合的K近邻的数据保留的数据的本地属性。的LLE最终选择的低维表示，最好保留在目标空间的权重。参考本R版本基础上由Sam Roweis的Matlab实现。


值----------Value----------

It returns a N x dim matrix (N samples, dim features) with the reduced input data
它返回与减少输入数据1为N×暗淡矩阵（N个样本，昏暗的功能）


作者（S）----------Author(s)----------



Christoph Bartenhagen




参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


## two dimensional LLE embedding of a 1.000 dimensional dataset using k=5 neighbours[＃两个维的LLE嵌入1.000三维数据集使用K = 5邻居]
d = generateData(samples=20, genes=1000, diffgenes=100, blocksize=10)
d_low = LLE(data=d[[1]], dim=2, k=5)

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