R语言 RDRToolbox包 generateData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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generateData(RDRToolbox)
generateData()所属R语言包：RDRToolbox

                                        Simulator for gene expression data
                                         基因表达数据的模拟器

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A simulator for gene expression data, whose values are normally distributed values with zero mean. The covariances are given by a configurable block-diagonal matrix. By default, half of the samples contain differential gene expression values (see parameter diffsamples).
基因表达数据，其值是正态分布的均值为零值的模拟器。协方差给出了一个可配置的块对角矩阵。默认情况下，一半的样本含有基因差异表达值（见参数diffsamples）。


用法----------Usage----------


generateData(samples=50, genes=10000, diffgenes=200, blocksize=50, cov1=0.2, cov2=0, diff=0.6, diffsamples)



参数----------Arguments----------

参数：samples
number of samples  
样本数


参数：genes
number of gene expression values per sample  
每个样品基因表达的数字值


参数：diffgenes
number of differential genes for class 1  
差异表达基因的数目为1级


参数：blocksize
size of each block in the blockdiagonal correlation matrix  
每个块的大小在的blockdiagonal相关矩阵


参数：cov1
covariance within the blocks in the correlation matrix  
协内的相关矩阵块


参数：cov2
covariance between the blocks in the correlation matrix  
协之间的相关矩阵块


参数：diff
difference between the random gene expression values and the differential gene expression values  
随机基因表达的价值和差异表达基因值的差异


参数：diffsamples
number of samples containing differential gene expression values compared to the rest (if missing, this parameter is set to half of the total number of samples)  
样本含有基因差异表达的数字值相比，其余的（如果缺少此参数设置为样本总数的一半）


Details

详情----------Details----------

The simulator generates two labeled classes:<br> label 1: samples with differentially expressed genes. <br> label -1: samples without differentially expressed genes.
模拟器会生成两个标记的类：参考标签1：差异表达的基因样本。参考-1标签：无差异表达的基因样本。


值----------Value----------

'generateData' returns a list containing:
“generateData返回一个列表，其中包含：


参数：data
a (samples x features)-matrix with the simulated gene expression values
（标本x的函数）基因的表达与模拟值矩阵


参数：labels
a vector with labels (1,-1) for the two classes
两个班为向量标签（1，-1）


作者（S）----------Author(s)----------



Christoph Bartenhagen




举例----------Examples----------


## generate a dataset with 20 samples and 1.000 gene expression values[＃生成一个有20个样品和1.000基因表达值的数据集。]
d = generateData(samples=20, genes=1000, diffgenes=100, blocksize=10)
data = d[[1]]
labels = d[[2]]

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注：
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