R语言 Rdisop包 decomposeIsotopes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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decomposeIsotopes(Rdisop)
decomposeIsotopes()所属R语言包：Rdisop

                                        Mass Decomposition of Isotope Patterns
                                         同位素模式的大规模分解

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculate the elementary compositions from an exact Mass or Isotope Pattern, obtained e.g.\ by FTICR or TOF mass spectrometers
从一个确切的质量或获得如\通过FTICR或飞行时间质谱仪，同位素模式计算的基本组成


用法----------Usage----------


decomposeMass(mass, ppm=2.0, mzabs=0.0001, elements=NULL, filter=NULL, z=0, maxisotopes = 10)
decomposeIsotopes(masses, intensities, ppm=2.0, mzabs=0.0001,
elements=NULL, filter=NULL,  z=0, maxisotopes = 10)
isotopeScore(molecule, masses, intensities, elements = NULL, filter = NULL, z = 0)



参数----------Arguments----------

参数：mass
A single exact mass (or m/z value)
一个单一的精确质量（m / z值）


参数：masses
A vector of masses (or m/z values) of an isotope cluster
同位素聚类的群众矢量（m / z值）


参数：intensities
Abolute or relative intensities of the masses peaks
masses峰abolute或相对强度


参数：ppm
allowed deviation of hypotheses from given mass
假设从给定质量的允许偏差


参数：mzabs
absolute deviation in dalton (mzabs and ppm will be added)
绝对偏差道尔顿（mzabs和PPM将被添加）


参数：z
charge z of m/z peaks for calculation of real mass. 0 is for auto-detection
真正大规模计算的m / z峰收取ž。 0自动检测


参数：maxisotopes
maximum number of isotopes shown in the resulting molecules
同位素在分子显示的最大数量


参数：elements
list of allowed chemical elements, defaults to CHNOPS
列表允许的化学元素，默认以CHNOPS


参数：filter
NYI, will be a selection of DU, DBE and Nitrogen rules
纽约摄影学院，将是一个选择杜，DBE和氮规则


参数：molecule
a molecule as obtained from getMolecule() or decomposeMass / decomposeIsotopes
作为getMolecule（）或decomposeMass / decomposeIsotopes的获得分子


Details

详情----------Details----------

Sum formulas are calculated which explain the given mass or isotope pattern.
总和计算公式解释的特定质量或同位素模式。


值----------Value----------

A list of molecules, which contain the sub-lists
一个分子的名单，其中包含子列表


参数：formula
potential formulae  
潜在的公式


参数：mass
exact monoisotopic mass of hypothesis  
假设确切的单一同位素质量


参数：score
calculated score  
计算得分


参数：isotopes
a list of isotopes   
同位素的列表


作者（S）----------Author(s)----------


Steffen Neumann <sneumann@IPB-Halle.DE>



参考文献----------References----------

WABI Paper

参见----------See Also----------

decomposeMass
decomposeMass


举例----------Examples----------


# For Glutamate: [谷氨酸：]
decomposeIsotopes(c(147.0529,148.0563), c(100.0,5.561173))

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