R语言 RCytoscape包 setEdgeColorRule()函数中文帮助文档(中英文对照)

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setEdgeColorRule(RCytoscape)
setEdgeColorRule()所属R语言包：RCytoscape

                                        setEdgeColorRule
                                         setEdgeColorRule

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Specify how data attributes – for the specified named attribute – is
指定数据属性 - 指定的命名属性 -


用法----------Usage----------


setEdgeColorRule(obj, edge.attribute.name, control.points, colors, mode, default.color='#FFFFFF')



参数----------Arguments----------

参数：obj
a CytoscapeWindowClass object.  
CytoscapeWindowClass对象。


参数：edge.attribute.name
the edge attribute whose values will, when this rule is applied, determine the color of each edge.
边缘属性的值时，将应用此规则，确定每个边缘的颜色。


参数：control.points
a list of values, either numeric (for  interpolate mode) or character strings (for 'lookup' mode).
一个值的列表，无论是数字（插值模式）或字符串（“查找”模式）。


参数：colors
a list of colors, expressed as hexadecimal RGB, like this:  '#FF0000' or '#FA8800'
名单，表示为十六进制的RGB颜色，像这样的：＃FF0000或＃FA8800“


参数：mode
either 'interpolate' or 'lookup'.
插或查找。


参数：default.color
a String object, expressed in  hexadecimal RGB, like this:  '#FF0000' or '#FA8800'
String对象的RGB十六进制表示，像这样的：＃FF0000或＃FA8800“


值----------Value----------

None.
没有。


作者（S）----------Author(s)----------


Paul Shannon



参见----------See Also----------

setEdgeLineStyleRule setNodeColorRule
setEdgeLineStyleRule setNodeColorRule


举例----------Examples----------


  cw <- new.CytoscapeWindow ('setEdgeColorRule.test', graph=makeSimpleGraph())
  edgeType.values = c ('phosphorylates', 'synthetic lethal', 'undefined')
  colors = c ('#FF0000', '#FFFF00', '#00FF00')[FF0000，＃FFFF00，＃00FF00）]
  setEdgeColorRule (cw, 'edgeType',  edgeType.values, colors, mode='lookup')

  score.values = c (-15, 0, 40);
  colors = c ('#00FF00', '#FFFFFF', '#FF0000')[00FF00，＃FFFFFF的，＃FF0000）]
  setEdgeColorRule (cw, 'score',  score.values, colors, mode='interpolate')
    # now swap the colors around[现在换了周围的颜色]
    # now swap the colors[现在换颜色]
  colors = c ('#FF0000', '#FFFFFF', '#00FF00')[FF0000，＃FFFFFF的，＃00FF00）]
  setEdgeColorRule (cw, 'score',  score.values, colors, mode='interpolate')

  redraw (cw)

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注：
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