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R语言 RCytoscape包 setEdgeAttributesDirect()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 12:21:16 | 显示全部楼层 |阅读模式
setEdgeAttributesDirect(RCytoscape)
setEdgeAttributesDirect()所属R语言包:RCytoscape

                                        setEdgeAttributesDirect
                                         setEdgeAttributesDirect

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Transfer the named edge attribute to Cytoscape.  This method is required, for instance, if you wish to run a 'movie.'  For example, if you have a timecourse experiment, with different values at successive time points  of the 'phosphorylates' or 'binds' relationship between two nodes.   With an edgeColor rule already specified, you can animate the display of the edges in the graph by pumping new values of the edge attributes, and then asking for a redraw.  An example of such edge-attribute-driven animation can be found here....[todo].
转移命名的边缘属性Cytoscape的。这种方法是必需的,例如,如果你想运行的“电影。”例如,如果你有1 timecourse实验,用不同的值,连续时间点的磷酸化或“结合”两个节点之间的关系。已经指定了一个edgeColor规则,你可以动画显示图中的边缘抽边缘属性的新值,然后要求重绘。等边缘属性驱动的动画,例如可以在这里找到...... [待办事项]。


用法----------Usage----------


setEdgeAttributesDirect(obj, attribute.name, attribute.type, edge.names, values)



参数----------Arguments----------

参数:obj
a CytoscapeWindowClass object.  
CytoscapeWindowClass对象。


参数:attribute.name
a string one of the attributes defined on the edges.  
string的边缘上定义的属性之一。


参数:attribute.type
a string from one of these three groups: (floating, numeric, double), (integer, int), (string, char, character).  This parameter is required because RCytoscape cannot always infer the type of an attribute.
string这三组:(浮动,数字,双),(整数,INT),(字符串,字符,字符)。此参数是必需,因为RCytoscape不能总是推断属性的类型。


参数:edge.names
a list of strings, edge names
list字符串,边缘名


参数:values
a list of objects of the type specified by 'attribute.name', one per edge
的由“attribute.name指定的类型的对象,每边的列表


值----------Value----------

None.
没有。


作者(S)----------Author(s)----------


Paul Shannon



参见----------See Also----------

setEdgeAttributes setNodeAttributes setNodeAttributesDirect
setEdgeAttributes setNodeAttributes setNodeAttributesDirect


举例----------Examples----------


  cw <- new.CytoscapeWindow ('setEdgeAttributesDirect.test', graph=makeSimpleGraph())
  edge.names = as.character (cy2.edge.names (cw@graph))
  stopifnot (length (edge.names) == 3)
  edge.values = c ('alligator', 'hedgehog', 'anteater')
  result = setEdgeAttributesDirect (cw, 'misc', 'string', edge.names, edge.values)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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