R语言 RamiGO包 readAmigoDot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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readAmigoDot(RamiGO)
readAmigoDot()所属R语言包：RamiGO

                                         Parser for the GraphViz DOT format.
                                         GraphViz的dot格式的解析器。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Reads DOT file or takes the output of getAmigoTree (with picType="dot") and returns an AmigoDot S4 object with a graph, adjacency matrix, edges and leaves and also the annotation for the nodes.
读取点文件或采取的getAmigoTree输出（带picType =“点”），并返回一个图，邻接矩阵，边缘和叶片和节点的注释一个AmigoDotS4对象。


用法----------Usage----------


readAmigoDot(object, filename)



参数----------Arguments----------

参数：object
A newline separated string in DOT format (as returned by getAmigoTree).  
以换行符隔开的字符串dot格式（返回getAmigoTree的）。


参数：filename
A .dot file in DOT format.  
一个点格式的文件。点。


值----------Value----------


参数：
An AmigoDot S4 object.
一个AmigoDot S4对象。


作者（S）----------Author(s)----------



Markus Schroeder <mschroed@jimmy.harvard.edu>




举例----------Examples----------


## set GO ID's and color[＃设置好编号和颜色]
goIDs <- c("GO:0051130","GO:0019912","GO:0005783")
color <- c("lightblue","red","yellow")

## get dot file / object[＃点文件/对象。]
dd <- getAmigoTree(goIDs=goIDs,color=color,
  filename="example",picType="dot",saveResult=TRUE)

## parse file or object[＃解析文件或对象。]
##tt1 &lt;- readAmigoDot(filename="example.dot")[这个＃TT1 < -  readAmigoDot（文件名=“example.dot”）]
tt2 <- readAmigoDot(object=dd)

## look at results[＃看看结果]
##show(tt1)[＃显示（TT1）]
show(tt2)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。