R语言 RamiGO包 exportCytoGML()函数中文帮助文档(中英文对照)

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exportCytoGML(RamiGO)
exportCytoGML()所属R语言包：RamiGO

                                         Writes out an igraph graph to a Cytoscape readable GML file.
                                         写出一个Cytoscape的可读的GML文件IGRAPH图。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Takes the igraph object edited in adjM2gml() and writes it to a GML file that is readable by Cytoscape.
注意到IGRAPH对象编辑在adjM2gml（），并将其写入到Cytoscape的可读的GML文件。


用法----------Usage----------


exportCytoGML(graph, filename)



参数----------Arguments----------

参数：graph
igraph graph (for example from adjM2gml()).  
IGRAPH图（例如从adjM2gml（））。


参数：filename
output filename.  
输出文件名。


作者（S）----------Author(s)----------



Markus Schroeder <mschroed@jimmy.harvard.edu>

Benjamin Haibe-Kains <bhaibeka@jimmy.harvard.edu>




举例----------Examples----------


## set GO ID's and color[＃设置好编号和颜色]
goIDs <- c("GO:0051130","GO:0019912","GO:0005783")
color <- c("lightblue","red","yellow")

dd <- getAmigoTree(goIDs=goIDs,color=color,
  filename="example",picType="dot",saveResult=FALSE)
tt <- readAmigoDot(object=dd)

## exportCytoGML is called inside adjM2gml[＃exportCytoGML是内adjM2gml称为]
adjM2gml(adjMatrix(tt),relations(tt)$color,
  annot(tt)$fillcolor,annot(tt)$GO_ID,
  annot(tt)$description,"example")

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。