R语言 rama包 ls.effect()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ls.effect(rama)
ls.effect()所属R语言包：rama

                                        Compute the least squares estimates of the all the effects of the
                                         计算最小二乘估计所有的影响

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Compute the least squares estimates of the all the effects of the general model.
计算最小二乘估计所有的一般模型的影响。


用法----------Usage----------


ls.effect(sample1,sample2,dye.swap=FALSE,nb.col1=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：sample1
The matrix of intensity from the sample 1. Each row corresponds to a different gene.
从样品1矩阵的强度。每一行对应一个不同的基因。


参数：sample2
The matrix of intensity from the sample 2. Each row corresponds to a different gene.
从样品2矩阵的强度。每一行对应一个不同的基因。


参数：dye.swap
A logical value indicating if the experiment was a dye swap experiment.
一个逻辑值，指出如果实验是一种染料交换实验。


参数：nb.col1
An integer value correspinding to the number of arrays (columns) in the first group of the dye swap experiment. In other words, the number of replicates before the dyes have been swaped.   
一个整数的价值correspinding阵列（列）在第一组的染料交换实验。换句话说，复制之前，染料已Valpha和Vbeta。


值----------Value----------


参数：mu
The baseline intensity
基准强度


参数：alpha2
The sample effect
样品效果


参数：beta2
The dye effect
染料的影响


参数：delta22
The dye*sample interaction
染料*样品相互作用


参数：eta
The array effects
数组的效果


参数：gamma1
The genes effects in sample 1
样品1的基因影响


参数：gamma2
The genes effect in sample 2
在样品2基因的影响


参数：M1
The main effects in sample 1
样品1的主要作用


参数：M2
The main effects in sample 2
样品2的主要作用


参数：R1
The residuals from the sample 1
从样品1的残差


参数：R2
The residuals from the sample 2
从样品2的残差


作者（S）----------Author(s)----------


Raphael Gottardo



参考文献----------References----------

Raphael Gottardo, Adrian E. Raftery, Ka Yee Yeung, and Roger Bumgarner

参见----------See Also----------

fit.model
fit.model


举例----------Examples----------


### Compute the least squares effects on the log scale[＃计算log规模最小二乘影响]
data(hiv)
ls.fx<-ls.effect(log2(hiv[,c(1:4)]),log2(hiv[,c(5:8)]),dye.swap=TRUE,nb.col1=2)

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