R语言 R453Plus1Toolbox包 plotAmpliconCoverage()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotAmpliconCoverage(R453Plus1Toolbox)
plotAmpliconCoverage()所属R语言包：R453Plus1Toolbox

                                        Creates a plot visualizing the number of reads per amplicon
                                         创建可视化的数量图读取每扩增

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function for visualizing the number of reads per amplicon
一个可视化的功能，读取每扩增


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'AVASet,character,logical'



参数----------Arguments----------

参数：avaSet
An instance of AVASet.
实例的AVASet。


参数：type
A character vector specifying the type of plot.
指定一个字符向量积类型。


参数：bothDirections
A logical value determining whether the plot sums forward and reverse reads or shows them separately.
一个逻辑值，决定是否图总结正向和反向读取或显示它们分开。


参数：cex.names
Font size of the amplicon name labels.
扩增名称标签的字体大小。


参数：cex.axis
Font size of axes' labels.
轴的标签的字体大小。


参数：las
Orientation of amplicon name labels.
扩增名称标签的定位。


参数：col
Colors used in the plot.
在小区使用的颜色。


参数：...
Arguments to be passed to methods, such as graphical parameters (see "par").
参数被传递到方法，如图形参数（见“面值”）。


Details

详情----------Details----------

If the argumnet type is “amplicon”, the number of reads for each amplicon are visualized. In case of a AVASet with one sample, a barplot with one bar for each amplicon is created. In case of more than one sample, a boxplot with one box for each amplicon is plotted. If type is “mid”, a boxplot with one box for each MID is created. If type  is “ptp”, a boxplot with one box for each pico titer plate is
，如果argumnet类型是“扩增”，读取的可视化，为每个扩增。在同一个样品AVASet的情况下，创建一个条形为每个扩增barplot。在多个样品的情况下，每个扩增盒盒形图绘制。如果类型是“中”，每个MID盒的盒形图被创建。如果类型是“PTP”，每个微型滴度板是用一个盒子的盒形图


作者（S）----------Author(s)----------


Hans-Ulrich Klein



参见----------See Also----------

AVASet
AVASet


举例----------Examples----------


## Not run: data(avaSetExample)[＃不运行：数据（avaSetExample）]
plotAmpliconCoverage(avaSetExample)
plotAmpliconCoverage(avaSetExample[,1])
## End(Not run)[＃结束（不运行）]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。