R语言 R453Plus1Toolbox包 nucleotideCharts()函数中文帮助文档(中英文对照)

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nucleotideCharts(R453Plus1Toolbox)
nucleotideCharts()所属R语言包：R453Plus1Toolbox

                                        Nucleotide Charts
                                         核苷酸图表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function plots the relative frequency of the four bases for each position in the sequences.
此功能图的四种碱基序列中的每个位置的相对频率。


用法----------Usage----------


  nucleotideCharts(object, range=0.95, linetypes=c(A="l", C="l", G="l", T="l", N="l"),
    linecols=c(A="black", C="red", G="blue", T="green", N="grey70"), xlab="Position",
    ylab="Frequency", ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
An object of class DNAStringSet, ShortRead or SFFContainer.
对象类DNAStringSet，ShortRead或SFFContainer。


参数：range
An integer vector of length one or two. If length one only bases up to the percent  quantile of read lengths defined by the given value are shown. A vector of length two gives the  start and end base between which the nucleotide frequencies are plotted.
一个或两个长度的整数向量。如果长度只有一个碱基了％分位数的定义给定值的读长。一个长度为2的向量，使碱基之间的核苷酸频率绘制的开始和结束。


参数：linetypes
The line types used for the four nucleotids + N, see (see "par")
四个nucleotids + N的行类型，请参阅（见“面值”）


参数：linecols
The colors in which the four nucleotids + N should be plotted.
颜色在这四个nucleotids + N的应绘制。


参数：xlab
The X axis label.
X轴的标签。


参数：ylab
The Y axis label.
Y轴的标签。


参数：...
Arguments to be passed to methods, such as graphical parameters (see "par").
参数被传递到方法，如图形参数（见“面值”）。


作者（S）----------Author(s)----------



Christian Ruckert


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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