featureDataAmp(R453Plus1Toolbox)
featureDataAmp()所属R语言包:R453Plus1Toolbox
Access the amplicon data of an AVASet
扩增数据一个AVASet访问
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Similar to featureData of the Biobase ExpressionSet, this function returns the feature data and feature meta of the amplicon slot of an instance of the AVASet.
类似featureDataBIOBASE ExpressionSet,这个函数返回的功能,数据和功能的一个实例的AVASet扩增槽元。
用法----------Usage----------
featureDataAmp(object)
参数----------Arguments----------
参数:object
An link{AVASet-class} object.
link{AVASet-class}对象。
值----------Value----------
The feature data of the amplicon slot contains the names, primers, start/end positions and reference sequences of all amplicons (see AVASet-class for details). The returned object is of class AnnotatedDataFrame.
扩增槽的特征数据包含的名字,引物,开始/结束位置和所有扩增的参考序列(见AVASet-class细节)。返回的对象是类的AnnotatedDataFrame。
作者(S)----------Author(s)----------
Christoph Bartenhagen
参见----------See Also----------
fDataAmp, assayDataAmp, AVASet-class,
fDataAmp,assayDataAmp,AVASet-class
举例----------Examples----------
# load an AVA dataset containing 6 samples, 4 amplicons and 259 variants[加载AVA的数据集,其中包含6个样品,4扩增和259变种]
data(avaSetExample)
avaSetExample
# show contents amplicon feature data[显示内容扩增功能数据]
featureDataAmp(avaSetExample)
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注:
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