avaSetFiltered_annot(R453Plus1Toolbox)
avaSetFiltered_annot()所属R语言包:R453Plus1Toolbox
AVASet variant annotations
AVASet变异的注解
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
These are example annotations for 4 variants of an AVASet (try data(avaSetFiltered) to retrieve the corresponding link{AVASet-class} object). The annotations include affected genes, exons and codons as well as resulting amino acid changes and dbSNP identifiers (if the mutation is already known).
这是4个变种的AVASet例如注释(尽量data(avaSetFiltered)检索相应link{AVASet-class}对象的)。注释包括受影响的基因,外显子和密码子以及导致氨基酸的变化和dbSNP的标识符(如果已知的突变)。
用法----------Usage----------
data(avaSetFiltered_annot)
格式----------Format----------
Formal class 'AnnotatedVariants'
正式的课堂“AnnotatedVariants”
源----------Source----------
"Next-generation sequencing technology reveals a characteristic pattern of molecular mutations in 72.8 leukemia by detecting frequent alterations in TET2, CBL, RAS, and RUNX1" (Kohlmann A et al., J Clin Oncol. 2010 Aug 20;28(24):3858-65. Epub 2010 Jul 19)
“下一代测序技术揭示了检测TET2,CBL的RAS,和RUNX1频繁改动了72.8白血病的分子突变特征模式”(Kohlmann A等治疗,歼2010 08月20日; 28(24) :3858-65。出处2010年7月19日)
举例----------Examples----------
data(avaSetFiltered_annot)
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注:
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