getInteractions(r3Cseq)
getInteractions()所属R语言包:r3Cseq
assign p-value and fold change to candidate interaction regions
分配P-值和倍候选人交互区域的变化
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Assign p-value and fold change to each candidate interaction regions by using empirical distribution function
P-值和褶皱的变化,以每名候选人的互动区域分配使用经验分布函数
用法----------Usage----------
getInteractions(object)
参数----------Arguments----------
参数:object
r3Cseq object. The object might contain the RPM generated by function getReadCountPerRestrictionFragment following by calculateRPM
r3Cseq对象。对象可能包含由功能getReadCountPerRestrictionFragment以下由calculateRPM产生的RPM
值----------Value----------
The candidate interaction regions show in the RangedData
候选人互动区域显示在RangedData
作者(S)----------Author(s)----------
S. Thongjuea
参见----------See Also----------
getCoverage, getReadCountPerRestrictionFragment, calculateRPM
getCoverage,getReadCountPerRestrictionFragment,calculateRPM
举例----------Examples----------
####Create the r3Cseq object#############[###创建r3Cseq对象#############]
library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
load(system.file("data","example.data.rda",package="r3Cseq"))
calculateRPM(my.data)
getInteractions(my.data)
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注:
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