R语言 r3Cseq包 contrCoverage()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

contrCoverage(r3Cseq)
contrCoverage()所属R语言包：r3Cseq

                                        Get the coverage for 3C-seq data from the control
                                         获取3C-SEQ数据的覆盖面，从控制

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Counts the number of times a position is represented in a set of input reads from 3C-seq data in the control
计数的位置是在一组输入代表的次数控制在3C-seq的数据读取


用法----------Usage----------


contrCoverage(object)



参数----------Arguments----------

参数：object
r3Cseq object, The initialize input parameters are required  
r3Cseq对象，初始化输入参数是必需的


值----------Value----------

For most methods, an Rle object representing the coverage of x. For RangesList and RangedData objects, a SimpleRleList object representing a list of coverage vectors.
对于大多数方法，RLE对象代表x的覆盖面。对于RangesList和RangedData对象，SimpleRleList对象代表一个覆盖向量列表。

An integer value called the "coverage" can be associated to each position in x, indicating how many times this position is covered by the elements contained in x. For example, if x is a Views object, the coverage of a given position in subject(x) is the number of views it belongs to.
被称为“覆盖”，可以关联一个整型值每个x的位置，说明这个位置由x包含的元素覆盖多少次。例如，如果x是一个视图对象，覆盖范围在一个给定的位置subject(x)是它所属的若干意见。


作者（S）----------Author(s)----------



S. Thongjuea




参见----------See Also----------

IRanges-class, Views-class, Rle-class, MaskCollection-class
IRanges-类，视图类，RLE一流的，一流的MaskCollection


举例----------Examples----------


       
####Create the r3Cseq object#############[＃＃＃创建r3Cseq对象＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃＃]
        library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
        load(system.file("data","example.data.rda",package="r3Cseq"))
        contr.coverage<-contrCoverage(my.data)

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