R语言 quantsmooth包 plotSmoothed()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotSmoothed(quantsmooth)
plotSmoothed()所属R语言包：quantsmooth

                                        plotSmoothed
                                         plotSmoothed

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot a smoothed line together with the original data values
绘制平滑的线，连同原始数据值


用法----------Usage----------


  plotSmoothed(intensities, position, ylim=NULL, ylab="intensity", xlab="position", normalized.to=NULL, grid=NULL, smooth.lambda=2, interval=0.5, plotnew=TRUE, cols, cex.pts = 0.6, ...)



参数----------Arguments----------

参数：intensities
numeric vector or matrix, data are plotted by column
数字向量或矩阵，数据按列绘制


参数：position
numeric vector; the length should be the number of rows in intensities
数字向量的长度应该是强度中的行数


参数：ylim
numeric vector of length 2, limits for plot. If NULL then the minimal and maximal value in intensities is used
向量长度为2的数字，限制图。如果NULL然后intensities最小和最大的价值是用来


参数：ylab
character, label for y-position
y位置，标签字符


参数：xlab
character, label for x-position
字符，标签为x位置


参数：normalized.to
numeric, a line(s) is drawn at this horizontal position
在这个水平位置绘制数字，一条线（S）


参数：grid
numeric, a line(s) is drawn at this vertical position
在此垂直位置绘制数字，一条线（S）


参数：smooth.lambda
numeric, smoothing parameter see quantsmooth
数字，平滑参数见quantsmooth


参数：interval
numeric (0..1), plotting of extra smoothed lines around median. With interval = 0.5 the 0.25 and 0.75 quartiles are plotted, with interval = 0.9 the 0.05 and 0.95 quantiles are plotted,  
数字（0 .. 1），绘制额外的平滑线左右的中位数。与intervalinterval= 0.9，0.05和0.95分位数绘制，绘制= 0.5，0.25和0.75四分


参数：plotnew
logical, if TRUE a new plot is created, else the data are plotted into an existing plot
逻辑，如果真创建一个新的图，否则这些数据绘制到现有的图


参数：cols
color vector, colors for columns in intensities  
颜色矢量，色列intensities


参数：cex.pts
size of the dots in the plot. Set to 0 to skip plotting the dots
图点的大小。设置0跳过绘制点


参数：...
extra parameters for plot
额外的参数plot


Details

详情----------Details----------

This function plots the raw data values as dots and the median smoothed values as a continuous line. If interval is supplied these are plotted as lines in different line types. More than 1 interval can be given.
此功能图的原始数据值作为点和平滑值中位数作为一个连续的行。如果间隔提供这些不同类型的线线绘制。可以超过1间隔。


值----------Value----------

This function is used for its side effects
此功能用于其副作用


作者（S）----------Author(s)----------


Jan Oosting



参见----------See Also----------

quantsmooth
quantsmooth


举例----------Examples----------


         data(chr14)
         plotSmoothed(bac.cn,bac.pos,ylim=c(1,2.5),normalized.to=2,smooth.lambda=2.5)

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