makeReport-methods(qrqc)
makeReport-methods()所属R语言包:qrqc
Make an HTML report from a FASTASummary of FASTQSummary object
从FASTQSummary对象FASTASummary HTML报告
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
makeReport takes a FASTQSummary or FASTASummary object, creates an HTML report, and writes it to a file within a directory. The directory naming is incremental so past reports will not be overwritten.
makeReport需要FASTQSummary或FASTASummary对象,创建一个HTML报告,并将其写入到一个文件在一个目录。目录命名为增量,所以过去的报告将不会被覆盖。
用法----------Usage----------
makeReport(obj, outputDir=".")
参数----------Arguments----------
参数:obj
an object that is either FASTQSummary or FASTASummary.
对象是要么FASTQSummary或FASTASummary。
参数:outputDir
an optional character argument to to indicate the report output directory. By default, the current directory.
一个可选的字符参数表明报表输出目录。默认情况下,当前目录。
作者(S)----------Author(s)----------
Vince Buffalo <vsbuffalo@ucdavis.edu>
举例----------Examples----------
## Load a FASTQ file, with sequence hashing.[#装入FASTQ的文件,序列的哈希。]
s.fastq <- readSeqFile(system.file('extdata', 'test.fastq', package='qrqc'))
## Make and save a report[#和保存报告]
makeReport(s.fastq)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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