R语言 puma包 plotWhiskers()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotWhiskers(puma)
plotWhiskers()所属R语言包：puma

                                        Standard errors whiskers plot
                                         标准误差晶须图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A plot showing error bars for genes of interest.
图表现出兴趣的基因错误的条形。


用法----------Usage----------


plotWhiskers(
        eset
,        comparisons=c(1,2)
,        sortMethod = c("logRatio", "PPLR")
,        numGenes=50
,        xlim
,        main = "PUMA Whiskers plot"
,        highlightedGenes=NULL
)



参数----------Arguments----------

参数：eset
An object of class ExpressionSet.  
对象类ExpressionSet。


参数：comparisons
A 2-element integer vector specifying the columns of data to be compared.  
一个2元的整数向量指定的数据列进行比较。


参数：sortMethod
The method used to sort the genes. "logRatio" is fold change. PPLR is Probability of Positive Log Ratio (as determined by the pumaDE method).  
该方法用于排序的基因。 “对数比”是倍的变化。 PPLR是正log比率（由pumaDE方法确定）的概率。


参数：numGenes
Integer. Number of probesets to plot.  
整数。图probesets。


参数：xlim
The x limits of the plot. See plot.default.  
图的X限制。看到plot.default。


参数：main
A main title for the plot. See plot.default.  
一个主标题为图。看到plot.default。


参数：highlightedGenes
Row numbers of probesets to highlight with an asterisk.  
probesets行突出带有星号的数字。


值----------Value----------

This function has no return value. The output is the plot created.
这个函数没有返回值。输出是创建的图。


作者（S）----------Author(s)----------


Richard D. Pearson



参见----------See Also----------

Related method pumaDE
此方法pumaDE

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