getPeaks(PROcess)
getPeaks()所属R语言包：PROcess
Peak Detection
峰值检测
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
For given threshold criteria, find peaks.
对于给定的阈值标准，发现峰。
用法----------Usage----------
getPeaks(bseoffM, peakinfofile,SoN = 2,span = 81,sm.span=11,
zerothrsh=2, area.w = 0.003, ratio = 0.2)
参数----------Arguments----------
参数：bseoffM
a matrix holding the baseline-substracted spectra, with row-names as the m/z values and column-names as the spectrum names.
矩阵为m / z值和频谱名列名列名中减去基线谱。
参数：peakinfofile
a ".csv" file in the same format as Ciphergen's peak info file, with 5 columns data. More details later.
“赛弗吉的峰值info文件相同的格式，有5列数据。CSV”文件。更多细节。
参数：SoN
see isPeak().
看到isPeak（）。
参数：span
see isPeak().
看到isPeak（）。
参数：sm.span
see isPeak().
看到isPeak（）。
参数：zerothrsh
ignore peaks whose intensity values are below zerothrsh.
忽略其强度值低于zerothrsh的峰。
参数：area.w
see isPeak().
看到isPeak（）。
参数：ratio
see isPeak().
看到isPeak（）。
Details
详情----------Details----------
For given threshold criteria, detect peaks and write the following columns of information into 'peakinfofile', spectrum name (Spectrum.Tag), spectrum sequential number (Spectrum.), peak sequential number within a spectrum (Peak.), relative intensity (Intensity) and the m/z value where the relative intensity occurs (Substance.Mass).
对于给定的阈值标准，检测峰，并写入以下信息栏peakinfofile“，谱名（Spectrum.Tag），频谱连续数（Spectrum.），峰值频谱内的顺序号（Peak.），相对强度（强度）和m / z值的相对强度发生的地方（Substance.Mass）。
作者（S）----------Author(s)----------
Xiaochun Li
参见----------See Also----------
rmBaseline
rmBaseline
举例----------Examples----------
example(renorm)
peakfile <- paste(tempdir(),"testpeakinfo.csv", sep="/")
getPeaks(rtM, peakfile)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-26 11:28:25
