R语言 preprocessCore包 normalize.quantiles()函数中文帮助文档(中英文对照)

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normalize.quantiles(preprocessCore)
normalize.quantiles()所属R语言包：preprocessCore

                                        Quantile Normalization
                                         位数标准化

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Using a normalization based upon quantiles, this function normalizes a matrix of probe level intensities.
此功能使用后位数为基础的标准化，规范化矩阵探针水平强度。


用法----------Usage----------


  normalize.quantiles(x,copy=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：x
A matrix of intensities where each column corresponds to a chip and each row is a probe.
芯片和每行每列对应的强度矩阵是一个探针。


参数：copy
Make a copy of matrix before normalizing. Usually safer to work with a copy, but in certain situations not making a copy of the matrix, but instead normalizing it in place will be more memory friendly.
请之前标准化矩阵的副本。一般安全工作副本，但在某些情况下，没有矩阵的副本，而是标准化到位，将更多的内存友好。


Details

详情----------Details----------

This method is based upon the concept of a quantile-quantile plot extended to n dimensions. No special allowances are made for outliers. If you make use of quantile normalization  please cite Bolstad et al, Bioinformatics (2003).
此方法是根据n维扩展到1位数位数图的概念。无特殊津贴离群。如果您使用的位数标准化，请举出Bolstad，生物信息学等（2003）。

This functions will handle missing data (ie NA values), based on the assumption that the data is missing at random.
这个函数将处理丢失的数据假设数据是随机缺失的基础上（即无值）。

Note that the current implementation optimizes for better memory usage at the cost of some additional run-time.
请注意，当前实现更好的内存使用一些额外的运行时间成本优化。


值----------Value----------

A normalized matrix.
一个规范化的matrix。


作者（S）----------Author(s)----------


Ben Bolstad, <a href="mailto:bmbolstad.com">bmbolstad.com</a>



参考文献----------References----------

Oligonucleotide Array Data. Unpublished manuscript http://bmbolstad.com/stuff/qnorm.pdf
A Comparison of Normalization Methods for High Density Oligonucleotide Array Data Based on Bias and Variance. Bioinformatics 19(2) ,pp 185-193. http://bmbolstad.com/misc/normalize/normalize.html

参见----------See Also----------

normalize.quantiles.robust
normalize.quantiles.robust

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注：
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