R语言 PREDA包 GenomicAnnotationsExtract()函数中文帮助文档(中英文对照)

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GenomicAnnotationsExtract(PREDA)
GenomicAnnotationsExtract()所属R语言包：PREDA

                                         extract optional annotations for a specific region
                                         为一个特定的区域中提取的可选注释

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

extract optional annotations for a specific region
为一个特定的区域中提取的可选注释


用法----------Usage----------


# GenomicAnnotationsExtract(.Object, chr, start, end,
# AnnotationsHeader=NULL, sep.character="; ",
# complete.inclusion=FALSE, skipSorting=FALSE,
# annotationAsRange=FALSE, getJustFeaturesNumber=FALSE)

GenomicAnnotationsExtract(.Object, ...)



参数----------Arguments----------

参数：.Object
An object of class GenomicAnnotations  
一个类GenomicAnnotations的对象


参数：...
See below     
见下文

chr: Coordinate for the selected genomic region   
CHR：为选定的基因组区域的坐标

start: Coordinate for the selected genomic region   
启动：为选定的基因组区域协调

end: Coordinate for the selected genomic region   
结束：为选定的基因组区域协调

AnnotationsHeader: Character or numeric vector to select the annotations columns to be considered   
AnnotationsHeader：选择被视为注解列的字符或数字向量

sep.character: Character used to separate annotated features in the ouptput   
sep.character：用于在ouptput分开的注释功能特征

complete.inclusion: Logical, if TRUE only annotated features completely included in the region are reported. If FALSE (default), every overlapping  the feature is considered.   
complete.inclusion：逻辑，如果TRUE，只有完全包括在该区域的注解功能报告。如果为FALSE（默认），被认为是每一个重叠的功能。

skipSorting: Logical, if TRUE, annotation sorting is skipped before processing output (to save computational time, e.g. in a long loop)   
skipSorting：逻辑，如果属实，注释排序跳过前处理输出（以节省计算时间，例如，在很长的循环）

annotationAsRange: If TRUE, then only the first and last annotated element in the region are reported   
annotationAsRange：如果为TRUE，那么只有在该区域的第一个和最后一个注解的元素报告

getJustFeaturesNumber: Logical: if TRUE, just the number of annotated features in the region is returned      
getJustFeaturesNumber：逻辑：如果为TRUE，只是在该区域的一些注释功能返回


Details

详情----------Details----------

Extract annotations associated to a specific genomic region  from a GenomiAnnotations object. Only annotations from the specified columns are returned.
提取从GenomiAnnotations对象关联到一个特定的基因组区域的注解。返回只从指定的列的注解。


值----------Value----------

A character vector is returned
返回一个特征向量


参见----------See Also----------

"GenomicAnnotations"
"GenomicAnnotations"

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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