lpe.paired(PLPE)
lpe.paired()所属R语言包:PLPE
Local Pooled Error Test for Paired Data
当地汇集成对数据的误差试验
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This invetigates differential expression for paired high-throughput data.
这invetigates配对的高通量数据的差异表达。
用法----------Usage----------
lpe.paired(x,...)
参数----------Arguments----------
参数:x
an object for which the extraction of model lpe.paired is meaningful.
模型提取lpe.paired对象是有意义的。
参数:...
other arguments
其他参数
值----------Value----------
参数:x
design matrix; condition index in the first column and pair index in the sceond column
设计矩阵;条件指数在第一列和一双在sceond列指数
参数:...
data type: 'ms' for mass spectrometry data, 'cdna' for cDNA microarray data
cDNA微阵列数据的数据类型:MS质谱数据,“基因”
作者(S)----------Author(s)----------
HyungJun Cho and Jae K. Lee
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
lpe.paired.default
lpe.paired.default
举例----------Examples----------
#LC-MS/MS proteomic data for platelets MPs[血小板MPS的LC-MS/MS蛋白质组数据]
library(PLPE)
data(plateletSet)
x <- exprs(plateletSet)
x <- log2(x)
cond <- c(1, 2, 1, 2, 1, 2)
pair <- c(1, 1, 2, 2, 3, 3)
design <- cbind(cond, pair)
out <- lpe.paired(x, design, q=0.1, data.type="ms")
out$test.out[1:10,]
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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