R语言 PICS包 pics()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

pics(PICS)
pics()所属R语言包：PICS

                                        Estimation of binding site positions
                                         结合位点位置的估计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This object contains Estimation of binding site positions and has the following  slots:  segReadsList, dataType.
此对象包含的结合位点的位置的估计，并具有以下插槽：segReadsList，数据类型。


用法----------Usage----------


PICS(segReadsList,dataType="TF")



参数----------Arguments----------

参数：segReadsList
This object contains segmentation of Genome
这个对象包含了基因组的分割


参数：dataType
The type of data you are  processing: specified "TF" for transcription factor.
您正在处理的数据类型：指定的的TF转录因子。


方法----------Methods----------




code signature(x = ``pics''): return the error code for each list element (i.e. candidate region) of a PICS object. If the string is empty, there were no errors.
代码signature(x = pics'')：每一个PICS对象的列表元素（即候选区域）返回错误代码。如果字符串是空的，没有任何错误。




plot signature(x = ``pics''): Plot all regions in the PICS object. This might be long, and should only be used to plot a few regions, so subset the object before plotting.
图signature(x = pics'')：绘制的PICS对象中的所有区域。这可能是术语的，应该只用于绘制一些区域，所以之前绘制的对象子集。




sigmaSqR signature(x = ``pics''): return the variance parameter of the reverse (R) distribution for each binding event.
sigmaSqRsignature(x = pics'')：返回方差参数的反向（R）的分布为每个绑定事件。




sigmaSqF signature(x = ``pics''): return the variance parameter of the forward (F) distribution for each binding event.
sigmaSqFsignature(x = pics'')：返回向前方差参数（F）的分布为每个绑定的事件。




score signature(x = ``pics''): return the score for each binding event.
得分signature(x = pics'')：返回每个绑定事件的得分。




scoreF signature(x = ``pics''): return the score  of the forward (F)  for each binding event.
scoreFsignature(x = pics'')：返回的前锋（F）的得分为每个绑定事件。




scoreR signature(x = ``pics''): return the score  of the forward (R)  for each binding event.
射手signature(x = pics'')：返回的前锋得分（R）的每个绑定事件。




maxRange signature(x = ``pics''): return the range maximum.
maxRangesignature(x = pics'')：返回的范围最大。




minRange signature(x = ``pics''): return the range minimal.
minRangesignature(x = pics'')：返回范围最小。




K signature(x = ``pics''): subset PICS object.
Ksignature(x = pics'')：子集的PICS对象。




density signature(x = ``pics''): return the density for each binding event.
密度signature(x = pics'')：返回密度为每个绑定事件。


作者（S）----------Author(s)----------


Xuekui Zhang, Arnaud Droit &lt;<a href="mailto:arnaud.droit@crchuq.ualaval.ca">arnaud.droit@crchuq.ualaval.ca</a>&gt; and Raphael Gottardo &lt;<a href="mailto:rgottard@fhcrc.org">rgottard@fhcrc.org</a>&gt;



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

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