plot.gseaSignatures(phenoTest)
plot.gseaSignatures()所属R语言包：phenoTest
GSEA-like Plot.
GSEA，像图。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Builds a GSEA plot using a gseaSignature object (one of gseaSignaturesSign or gseaSignaturesVar obtained with the gseaSignatures function) and a gseaSignificance object (one of gseaSignificanceSign or gseaSignificanceVar obtained with the gseaSignificance function).
GSEA图建立一个使用gseaSignature对象（gseaSignaturesSign或gseaSignaturesVargseaSignatures函数获得）和gseaSignificance对象（一个gseaSignificanceSign或gseaSignificanceVar获得gseaSignificance功能）。
用法----------Usage----------
plot.gseaSignaturesSign(x,gseaSignificance,es.ylim,nes.ylim,es.nes="both",...)
plot.gseaSignaturesVar(x,gseaSignificance,es.ylim,nes.ylim,es.nes="both",...)
参数----------Arguments----------
参数：x
object of class gseaSignaturesSign or gseaSignatures Var.
对象的类gseaSignaturesSign或gseaSignatures Var。
参数：gseaSignificance
object of class gseaSignificanceSign or gseaSignificanceVar.
对象的类gseaSignificanceSign或gseaSignificanceVar。
参数：es.ylim
ylim values for the ES plot.
为ES图ylim值。
参数：nes.ylim
ylim values for the NES plot.
未列明在其他图ylim值。
参数：es.nes
can be "es" if we want to plot enrichment score, "nes" if we want to plot normalised enrichment scores or "both"if we want to plot them both.
可以是“ES”，如果我们要绘制浓缩得分，“未列明在”如果我们要绘制归富集分数或“both”如果我们要绘制他们俩。
参数：...
Arguments to be passed to plot.
参数被传递到plot。
作者（S）----------Author(s)----------
Evarist Planet
参考文献----------References----------
www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.0506580102
举例----------Examples----------
#for examples see the help file of gseaSigntaures: ?gseaSignatures[看到的例子，gseaSigntaures帮助文件：gseaSignatures]
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-26 11:06:10
