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R语言 phenoTest包 gseaSignaturesSign-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:05:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
gseaSignaturesSign-class(phenoTest)
gseaSignaturesSign-class()所属R语言包:phenoTest

                                        Class "gseaSignaturesSign"
                                         类“gseaSignaturesSign”

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class is an ES (enrichment score) and ES.sim (simulated enrichment score) container that will be used in the GSEA (Gene Set Enrichment Analysis) process. There is one container for every gene signature.
这个类是一个ES(富集得分)和ES.sim(模拟富集得分的)容器将在,GSEA(基因组富集分析)过程中使用。每一个基因签名有一个容器。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("gseaSignaturesSign", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("gseaSignaturesSign", ...)。


插槽----------Slots----------




.Data: Object of class "list" .
.Data类"list"的对象。




gseaSignatures: Object of class "gseaSignatures" This is the object that will contain the
gseaSignatures:Object类的"gseaSignatures"这是对象将包含




fc.hr: Object of class "character" fold change
fc.hr类"character"倍对象




s: Object of class "logical" The subset of
s:Object类的"logical"子集




test: Object of class "character" The
test类"character":对象


延伸----------Extends----------

Class "list", from data part. Class "vector", by class "list", distance 2. Class "AssayData", by class "list", distance 2.
类"list",从数据的一部分。类"vector",由类“列表”,距离为2。类"AssayData",由类“列表”,距离为2。


方法----------Methods----------




getEs signature(x = "gseaSignaturesSign"): Returns the
getEssignature(x = "gseaSignaturesSign"):返回




getEsSim signature(x = "gseaSignaturesSign"): Returns the simulated enrichemt scores (the ones obtained after
getEsSimsignature(x = "gseaSignaturesSign"):返回后获得的模拟(enrichemt分数




getFcHr signature(x = "gseaSignaturesSign"): Returns the fold change and/or the hazard ratio that were used to compute
getFcHrsignature(x = "gseaSignaturesSign"):返回倍的变化和/或危害的比例分别用于计算




gseaSignificance signature(x = "gseaSignaturesSign"): This is the next step in the process of performing GSEA. This
gseaSignificancesignature(x = "gseaSignaturesSign"):这是GSEA执行过程中的下一步。这


作者(S)----------Author(s)----------


Evarist Planet



举例----------Examples----------


showClass("gseaSignaturesSign")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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