svdPca(pcaMethods)
svdPca()所属R语言包:pcaMethods
Perform principal component analysis using singular value
利用奇异值进行主成分分析
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A wrapper function for prcomp to deliver the result as a pcaRes method. Supplied for compatibility with the rest of the pcaMethods package. It is not recommended to use this function directely but rather to use the pca() wrapper
一个prcomp提供pcaRes方法的结果,包装功能。提供与其他的pcaMethods包的兼容性。这是不建议使用此功能directely而是使用pca()包装
用法----------Usage----------
svdPca(Matrix, nPcs=2, varLimit=1, verbose=interactive(), ...)
参数----------Arguments----------
参数:Matrix
Pre-processed (centered and possibly scaled) numerical matrix samples in rows and variables as columns. No missing values allowed.
预加工(集中和可能规模的行和列作为变量)数值矩阵样品。允许无遗漏值。
参数:nPcs
Number of components that should be extracted.
应提取的元件数目。
参数:varLimit
Optionally the ratio of variance that should be explained. nPcs is ignored if varLimit < 1
可选的方差的比率,应加以解释。 nPcs被忽略如果varLimit <1
参数:verbose
Verbose complaints to matrix structure
详细的投诉矩阵结构
参数:...
Only used for passing through arguments. </table>
仅用于通过参数传递。 </ TABLE>
值----------Value----------
A pcaRes object.
一个pcaRes对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Henning Redestig
参见----------See Also----------
prcomp, princomp, pca
prcomp,princomp,pca
举例----------Examples----------
mat <- prep(t(metaboliteDataComplete))
pc <- svdPca(mat, nPcs=2)
## better use pca()[#更好地利用PCA()]
pc <- pca(t(metaboliteDataComplete), method="svd", nPcs=2)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|