R语言 pathRender包 plotExGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotExGraph(pathRender)
plotExGraph()所属R语言包：pathRender

                                        plot a gene network, coloring nodes according
                                         绘制基因网络，节点根据着色

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

plot a gene network, coloring nodes according
绘制基因网络，节点根据着色


用法----------Usage----------


plotExGraph(g, es, sampind=1, pal=colorRampPalette(brewer.pal(9, "Blues"))(length(nodes(g))), attgen=pwayRendAttrs)



参数----------Arguments----------

参数：g
graph representing a gene network
图代表一个基因网络


参数：es
an ExpressionSet instance  
ExpressionSet实例


参数：sampind
sample to be used  to obtain relative expression values  
样品可用于获取相对表达值


参数：pal
palette for coloring the nodes
调色板着色节点


参数：attgen
attribute generating function  
属性生成功能


Details

详情----------Details----------

plots a colored network on the current graphics display
图对当前图形显示彩色网络


值----------Value----------

as returned by Rgraphviz plot method for graphNEL instances
返回Rgraphviz图法graphNEL实例


作者（S）----------Author(s)----------


Vince Carey <stvjc@channing.harvard.edu>



举例----------Examples----------


library(graph)
data(pancrCaIni)
library(ALL)
data(ALL)
library(hgu95av2.db)
collap1 = reduceES( ALL, nodes(pancrCaIni), revmap(hgu95av2SYMBOL), "symbol", mean )
library(RColorBrewer)
plotExGraph( pancrCaIni, collap1, 1 )

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。