R语言 OTUbase包 subTAXset()函数中文帮助文档(中英文对照)

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subTAXset(OTUbase)
subTAXset()所属R语言包：OTUbase

                                        subTAXset
                                         subTAXset

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to get a subset of an TAXset object.
函数来获取一个TAXset对象的一个子集。


用法----------Usage----------



subTAXset(object, samples)




参数----------Arguments----------

参数：object
An TAXset object
一个TAXset对象


参数：samples
A list of sample names
样品名称列表


值----------Value----------

subTAXset returns an TAXset
subTAXset返回一个TAXset


举例----------Examples----------



## locate directory with data[＃定位数据目录]
dirPath <- system.file("extdata/Sogin_2006", package="OTUbase")

## read in data into TAXset object[＃读取数据TAXset对象]
soginTAX <- readTAXset(dirPath=dirPath, samplefile="sogin.groups", fastafile="sogin.fasta", taxfile="sogin.unique.fix.tax",namefile="sogin.names", sampleADF="sample_metadata.txt")

## get subset of soginTAX[＃得到soginTAX子集。]

subTAXset(soginTAX, samples=getSamples(soginTAX, colnum="Site", value="Labrador", exact=FALSE))


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