R语言 OTUbase包 .TAXset-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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.TAXset-class(OTUbase)
.TAXset-class()所属R语言包：OTUbase

                                        "TAXset" class for TAX data
                                         “TAXset”类税收数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class provides a way to store and manipulate read-classification data. ".TAXset" is inherited by "TAXsetQ", "TAXsetF", and "TAXsetB". The user will want to use "TAXsetQ" when quality data is available, "TAXsetF" when sequence data (without quality data) is available, and "TAXsetB" when only classification and sample data are available.
这个类提供了一种方法来存储和处理读分类数据。继承由“TAXsetQ”“。TAXset”，“TAXsetF”，“TAXsetB”。用户将要使用“TAXsetQ”质量数据可用时，的“TAXsetF”序列数据时没有高质量的数据是可用的，和“TAXsetB”时，唯一的分类和样本数据。


插槽----------Slots----------

TAXsetB includes Slots id, sampleID, tax, sampleData, assignmentData.
TAXsetB包括角子机id，sampleID，tax，sampleData，assignmentData。

TAXsetF includes Slots id sampleID, tax, sampleData, assignmentData, sread.
TAXsetF包括角子机idsampleID，tax，sampleData，assignmentData，sread。

TAXsetQ includes Slots id sampleID, tax, sampleData, assignmentData, sread, quality.
TAXsetQ包括角子机idsampleID，tax，sampleData，assignmentData，sread，quality。


方法----------Methods----------

Methods include:
方法包括：




id provides access to the id slot of object
ID提供访问的的object ID插槽




sampleID provides access to the sampleID slot of object
sampleIDobject sampleID插槽提供了访问




tax provides access the tax slot of object
税提供访问object税务插槽




sampleData provides accesss the sampleData slot of object
的sampleData提供accesss的的object的sampleData插槽




assignmentData provides access the assignmentData slot of object
assignmentData提供访问的的object assignmentData插槽




sread provides access to the sread slot of object
SREADobject SREAD插槽提供了访问




quality provides access to the quality slot of object
质量提供访问的的object质量插槽




seqnames returns the first word of the id line. Intended to extract the sequence name from other sequence information.
seqnames返回的ID行的第一个字。旨在从其他序列信息的提取序列的名称。




nsamples returns the number of samples in an TAXset object
nsamples在TAXset对象返回的样本数量




show signature(object=".TAXset"): provides a brief summary of the object, including its class, number of sequences, and number of samples.
显示signature(object=".TAXset")：提供简要的对象，包括其类，序列数，样本数。


举例----------Examples----------


showClass(".TAXset")
showMethods(class=".TAXset")
showClass("TAXsetQ")

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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