R语言 ontoTools包 OOC-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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OOC-class(ontoTools)
OOC-class()所属R语言包：ontoTools

                                        Class "OOC" object-ontology complex
                                         类“正交码”对象的本体复杂

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Object that binds ontology (structured vocabulary) with
对象，结合本体（结构化的词汇）


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("OOC", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("OOC", ...)。


插槽----------Slots----------




ontology: Object of class "ontology" instance of ontoTools:ntology
ontology类"ontology"ontoTools的实例对象::本体




OOmap: Object of class "namedSparse" SparseM::matrix.csr bound with dimnames facilities
OOmap：对象类"namedSparse"的SparseM :: matrix.csr约束dimnames设施


方法----------Methods----------




coverageMat signature(x = "OOC"): return a namedSparse incidence matrix with r,c element indicating whether term c covers
coverageMatsignature(x = "OOC")：返回与R namedSparse发病率矩阵，C元素说明是否术语C涉及




ontology signature(x = "OOC"): accessor
本体signature(x = "OOC")：存取




OOmap signature(x = "OOC"): accessor
OOmapsignature(x = "OOC")：存取




show signature(object = "OOC"): concise printer
显示signature(object = "OOC")：简洁打印机“


作者（S）----------Author(s)----------


VJ Carey <stvjc@channing.harvard.edu>



举例----------Examples----------


data(litOnto)
g1 <- new("rootedDAG", DAG=litOnto, root="A")
o1 <- new("ontology", name="demo", version="0.1",
        rDAG=g1)
kvlist <- list(W="E", X="K", Y="B", Z=c("D","G"))
litMap <- otkvList2namedSparse( names(kvlist), LETTERS[1:12], kvlist )
print(litMap)
ooc1 <- makeOOC( o1, litMap )
show(ooc1)
print(coverageMat(ooc1))
# note the following will be slow with large OOCs[注意以下几点将是缓慢的大光正交码]
print(conceptProbs(ooc1))
# for larger OOCs it is useful to precompute the accessibility[较大的光正交码，它是非常有用的预先计算的辅助]
# matrix of the ontology and the map from objects to terms -- these[矩阵的本体和从对象方面的图 - 这些]
# can be supplied as additional arguments to conceptProbs[可提供额外的参数作为conceptProbs]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。