R语言 ontoCAT包 getOntology()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getOntology(ontoCAT)
getOntology()所属R语言包：ontoCAT

                                        Returns an instance of the ontology parser created from OWL or OBO file. Reasoning over ontologies and extracting relationships is supported by using HermiT reasoner.
                                         返回本体解析器从OWL或OBO的文件创建的一个实例。对本体和提取关系的推理支持使用隐士推理。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Loads the ontology described in OWL or OBO format from the local file or on the fly by using URL.
加载本体OWL或OBO的格式，通过使用URL从本地文件或动态描述。


用法----------Usage----------


    getOntology(pathToURI)



参数----------Arguments----------

参数：pathToURI
a character string giving the URL or local name of the file to load ontology from
一个字符串，使该文件的URL或本地名称载入本体


值----------Value----------

Returns an instance of the Ontology class.
返回Ontology类的一个实例。


作者（S）----------Author(s)----------


Natalja Kurbatova



参考文献----------References----------







参见----------See Also----------

Ontology and OntologyTerm
Ontology和OntologyTerm


举例----------Examples----------


    ontologyFromURL <- getOntology("http://www.ebi.ac.uk/efo/efo.owl")
    getOntologyRelationNames(ontologyFromURL)
    getTermParentsById(ontologyFromURL,"EFO_0001221")
    ontologyFromFile <- getOntology("./ontoCAT/extdata/cell.obo")
    getAllTermIds(ontologyFromFile)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。