R语言 OLIN包 sigxy.plot2()函数中文帮助文档(中英文对照)

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sigxy.plot2(OLIN)
sigxy.plot2()所属R语言包：OLIN

                                        Visualisation of significance tests for spatial bias
                                         可视化的空间偏见显着性检验

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function produces a 2D-plot visualizing the significance
这个函数生成一个二维图可视化的意义


用法----------Usage----------


sigxy.plot2(object,Sp,Sn,color.lim=c(-3,3),...)



参数----------Arguments----------

参数：object
object of class marrayRaw or marrayNorm
对象类marrayRaw或marrayNorm


参数：Sp
vector of false discovery rates or p-values  for positive deviation of  median/mean of \code{M} as produced by fdrspatial or p.spatial
虚假的发现率或p值正偏差向量median/mean of \code{M}生产fdrspatial或p.spatial，


参数：Sn
vector of false discovery rate or p-values for negative deviation of median/mean of \code{M} as produced by fdrspatial or p.spatial
虚假的发现率或为负偏差median/mean of \code{M}fdrspatial或p.spatial生产的P-值向量


参数：color.lim
limits of color range for plotting vector corresponding to log10(pS) and log10(nS)
色彩范围的限制绘制矢量LOG10（pS）和log10（nS）


参数：...
Further optional graphical parameter for the image function generating the MXY plot
进一步可选参数image函数的图形生成MXY图


Details

详情----------Details----------

The function sigxy.plot2 differs from sigxy.plot in its input arguments.
从sigxy.plot2在其输入参数不同的功能sigxy.plot。


注意----------Note----------

This function will be merged with sigxy.plot in future versions.
在未来的版本中，此功能将被合并sigxy.plot。


作者（S）----------Author(s)----------


Matthias E. Futschik (<a href="http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik">http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik</a>)



参见----------See Also----------

colorbar.sig, sigxy.plot,
colorbar.sig，sigxy.plot


举例----------Examples----------



# To run these examples, "un-comment" them![要运行这些例子，“联合国发表评论”他们！]
#[]
# LOADING DATA[加载数据]
# data(sw)[数据（SW）]
# CALCULATION OF SIGNIFICANCE OF SPOT NEIGHBOURHOODS[作者：现货，邻里意义的计算]
# For this illustration, N was chosen rather small. For "real" analysis, it should be larger.[对于这个例子，N的选择相当小。 “真实”的分析，它应该更大。]
# FDR &lt;- fdr.spatial2(sw,delta=2,N=10,av="median",edgeNA=TRUE)[FDR< -  fdr.spatial2（SW，δ= 2，N = 10，，AV =“中位数”，edgeNA = TRUE时）]
#[]
# SIGNIFICANCE PLOTS OF ARRAY 1[阵列的意义图]
# sigxy.plot2(sw[,1],FDR$FDRp[[1]],FDR$FDRn[[1]],color.lim=c(-5,5),main="FDR")[sigxy.plot2（SW [1]，FDR$ FDRp [1]，FDRFDRn [1]，color.lim = C（-5,5），主要=“FDR”）]
# SIGNIFICANCE PLOTS OF ARRAY 3[3阵列的意义图]
# sigxy.plot2(sw[,3],FDR$FDRp[[3]],FDR$FDRn[[3]],color.lim=c(-5,5),main="FDR")[sigxy.plot2（SW [3]，FDR$ FDRp [3]，FDR美元FDRn [3]，color.lim = C（-5,5），主要=“FDR”）]
#[]


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