tstatistics(OCplus)
tstatistics()所属R语言包：OCplus
Compute multiple parallel t-statistics
计算多个并行t-统计
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
tstatistics computes either two-sample or paired t-statistics for a bunch of variables measured on the same objects, e.g. genewise t-statistics for a microarray experiment. PermNull uses tstatistics to generate a permutation distribution.
tstatistics计算两个样本或配对t-统计量，对同一对象测量的变量一堆，例如2-6。t-统计量为芯片实验。 PermNull使用tstatistics生成一个置换分布。
用法----------Usage----------
tstatistics(xdat, grp, logse = FALSE, paired = FALSE)
PermNull(xdat, grp, nperm = 100, seed = NULL, logse = FALSE, paired=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数：xdat
the matrix of expression values, with genes (or variables) as rows and samples as columns.
矩阵，行和列的样本（或变量）的基因表达值。
参数：grp
a grouping variable giving the class membership of each sample, i.e. each column in xdat, see Details.
分组给每个样品的类成员变量，即每个列在xdat，看到详细信息。
参数：nperm
number of permutations for establishing the null distribution of the t-statistic
建立空分布的t-统计数排列
参数：seed
random number generator seed for initializing the permutations from a known starting point.
随机数发生器的种子初始化的排列，从已知的起点。
参数：logse
logical flag indicating whether to return the logarithmized standard errors, too.
逻辑的指示标志是否返回logarithmized的标准误差，太。
参数：paired
indicates whether to use two-sample or paired t-statistic.
表示是否使用两样本或配对t-统计。
Details
详情----------Details----------
tstatistics is a fairly fast replacement for function mt.teststat in package multtest, which is written exlusively in R and does not require loading half the Bioconductor infrastructure packages before doing anything. As such, it is used for computing the default test statistics by fdr1d and fdr2d.
tstatistics是一个功能相当快速更换mt.teststat包multtest，这是在R写入exlusively，不需要做任何事情之前，加载一半Bioconductor基础设施包。因此，它被用于计算默认的测试统计fdr1d和fdr2d。
Note that for the paired test, tstatistics requires the same data structure as mt.teststat: columns belonging to the same pair must be consecutive (though not necessarily in the same order throughout, as grp will indicate the order). The function checks for this and barfs if it does not hold.
请注意，配对测试，tstatistics需要相同的数据结构作为mt.teststat：列属于同一对的，必须是连续的（虽然不一定在同一顺序整个grp会指示的顺序）。的功能检查barfs，如果它不持有。
PermNull returns the t-statistics and optionally the logarithmized standard errors of the mean for a specified number of permutations.
PermNull返回指定数量的排列的t-统计量和可选logarithmized平均值的标准误差。
Both functions are not especially economic in using memory, and collecting the whole set of permutations like PermNull does instead of binning and counting them directly as they come is inherently wasteful.
这两个功能是不经济，尤其是在使用内存，并收集一整套的排列像PermNull binning和他们直接计数，因为他们来本质上是浪费。
值----------Value----------
A data frame with first column tstat and optionally (if logse=TRUE) a second column logse. tstat returns the same number of test statistics as rows in xdat and in the same order, PermNull does the same for consecutive permuations of the grouping variable grp.
与第一列的数据框tstat和可选（如果logse=TRUE）第二列logse。 tstat返回行中的相同数量的测试统计xdat“以相同的顺序，PermNull不为分组变量grp连续permuations相同。
If the argument seed is specified, PermNull adds an attribute of the same name to the returned data frame.
如果指定的参数seed，PermNull添加一个相同名称的属性返回的数据框。
作者（S）----------Author(s)----------
A. Ploner
参见----------See Also----------
fdr1d, fdr2d, examples in tMixture
fdr1d，fdr2d，tMixture的例子
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-26 08:03:37
