R语言 NuPoP包 plotNuPoP()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotNuPoP(NuPoP)
plotNuPoP()所属R语言包：NuPoP

                                        R function for plotting the predicted nucleosome positioning map and nucleosome occupancy map
                                         R函数绘制预测的核小体定位图和核小体占用图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function produces two plots from a specified region based on the prediction results from function predNuPoP. The first plot is the nucleosome occupancy (grey color). In the second plot, in addition to the occupancy,  Viterbi prediction (red rectangle) and the posterior probability for a position to be the start of a nucleosome (blue color) are superimposed.
此功能产生两个指定区域的图的基础上，从功能predNuPoP预测结果。第一个图是核小体占用（灰色）。在第二个图，除了占用，维特比预测（红色矩形）和位置的后验概率是一个核小体（蓝色）叠加的开始。


用法----------Usage----------


plotNuPoP(predNuPoPResults)



参数----------Arguments----------

参数：predNuPoPResults
NuPoP prediction results from predNuPoP function. It must be a data frame read in by readNuPoP function.
NuPoP predNuPoP功能的预测结果。它必须是一个数据框读取readNuPoP功能。


值----------Value----------

plotNuPoP outputs two plots: the nucleosome occupancy score map and Viterbi optimal nucleosome positioning map together with posterior probability for a position to be the start of a nucleosome.
plotNuPoP输出两图：核小体占用得分图和维特比最优的核小体定位图的位置是一个核小体开始后验概率。


举例----------Examples----------


library(NuPoP)

## the prediction results are stored in the current working directory[＃的预测结果都存储在当前工作目录]
## the user should replace "system.file("extdata","test.seq_Prediction4.txt",package="NuPoP")"[＃用户应取代“。系统（”extdata“，”test.seq_Prediction4.txt“，包=的”NuPoP“）”]
## by the actual path and file name generated from prediction.[＃从预测产生的实际路径和文件名。]
temp=readNuPoP(system.file("extdata","test.seq_Prediction4.txt",package="NuPoP"),startPos=1,endPos=5000)
plotNuPoP(temp)

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