nucleosome_tiling(nucleR)
nucleosome_tiling()所属R语言包:nucleR
Example intensities from Tiling Microarray nucleosome positioning experiment
例如强度从瓦片芯片核小体定位实验
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Some bases from S.cerevisiae tiling microarray where mononucleosomes were sequenced and hybridizated with histone-free naked DNA. The intensity is the normalized ratio between the intensities from nucleosomic and naked DNA.
从酿酒酵母平铺的芯片,其中mononucleosomes进行测序,并与裸DNA组蛋白hybridizated一些碱基。强度从nucleosomic和裸DNA的强度之间的标准化比值。
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用法----------Usage----------
data(nucleosome_tiling)
格式----------Format----------
numeric vector with the intensities.
numeric向量的强度。
Details
详情----------Details----------
The raw .CEL files from Affymetrix S.Cerevisiae Tilling 1.0R Array (3 nucleosomal + 3 naked DNA) has been merged using package Starr and the resulting ExpressionSet object has been passed to processTilingArray function from this package as follows:
原料。CEL文件耕1.0R阵列从Affymetrix公司的酿酒酵母(3核小体+ 3个裸DNA)已被合并使用Starr和由此产生的ExpressionSet对象已传递给processTilingArray的包从这个包的功能如下:
processTilingArray(data, exprName, chrPAttern="Sc:Oct_2003;chr1", closeGaps=50)
processTilingArray(data, exprName, chrPAttern="Sc:Oct_2003;chr1", closeGaps=50)
The first 8000bp of the chr1 have been saved as this example dataset.
例如数据集,因为这已保存的chr1第一8000bp。
源----------Source----------
Publication pending
出版等候
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注:
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