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R语言 nucleR包 nucleosome_tiling()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 07:54:44 | 显示全部楼层 |阅读模式
nucleosome_tiling(nucleR)
nucleosome_tiling()所属R语言包:nucleR

                                         Example intensities from Tiling Microarray nucleosome positioning experiment
                                         例如强度从瓦片芯片核小体定位实验

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Some bases from S.cerevisiae tiling microarray where mononucleosomes were sequenced and hybridizated with histone-free naked DNA. The intensity is the normalized ratio between the intensities from nucleosomic and naked DNA.
从酿酒酵母平铺的芯片,其中mononucleosomes进行测序,并与裸DNA组蛋白hybridizated一些碱基。强度从nucleosomic和裸DNA的强度之间的标准化比值。

Due to the difficulty of providing a raw file, this file has been preprocessed. See details.
由于难以提供原始文件,该文件已被预处理。查看详情。


用法----------Usage----------


data(nucleosome_tiling)



格式----------Format----------

numeric vector with the intensities.
numeric向量的强度。


Details

详情----------Details----------

The raw .CEL files from Affymetrix S.Cerevisiae Tilling 1.0R Array (3 nucleosomal + 3 naked DNA) has been merged using package Starr and the resulting ExpressionSet object has been passed to processTilingArray function from this package as follows:
原料。CEL文件耕1.0R阵列从Affymetrix公司的酿酒酵母(3核小体+ 3个裸DNA)已被合并使用Starr和由此产生的ExpressionSet对象已传递给processTilingArray的包从这个包的功能如下:

processTilingArray(data, exprName, chrPAttern="Sc:Oct_2003;chr1", closeGaps=50)
processTilingArray(data, exprName, chrPAttern="Sc:Oct_2003;chr1", closeGaps=50)

The first 8000bp of the chr1 have been saved as this example dataset.
例如数据集,因为这已保存的chr1第一8000bp。


源----------Source----------

Publication pending
出版等候

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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