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R语言 nucleR包 nucleosome_htseq()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 07:54:35 | 显示全部楼层 |阅读模式
nucleosome_htseq(nucleR)
nucleosome_htseq()所属R语言包:nucleR

                                         Example reads from high-troughtput sequencing nucleosome positioning experiment
                                         例如读取从的高troughtput测序核小体定位实验

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Few reads from paired-ended MNase-seq experiment in S.cerevisiae where mononucleosomes were sequenced
几读取配对截至MNase-seq的酿酒酵母中的实验进行测序mononucleosomes的地方


用法----------Usage----------


data(nucleosome_htseq)



格式----------Format----------

RangedData with the range of the reads and a data column with the strand information.
RangedData读取范围和数据链信息栏。


Details

详情----------Details----------

This data is obtained from MNase digested nucleosomal DNA and sequenced with Illumina platform. Paired-ended reads where mapped to SacCer1 genome using Bowtie, and imported to R using the package ShortRead and paired ends where merged into a single range.
这个数据得到从MNase消化核小体的DNA测序Illumina平台。配对结束读取映射到使用领结SacCer1基因,并导入到R包ShortRead配对最终在合并成一个单一的范围。

Reads were sorted by chromosome and starting position and only a few reads from the starting positions of chromosome 1 are presented.
读取由染色体和起始位置进行排序,只有少数读取从1号染色体的出发提出的立场。


源----------Source----------

Publication pending
出版等候

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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