R语言 NTW包 methods.regression()函数中文帮助文档(中英文对照)

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methods.regression(NTW)
methods.regression()所属R语言包：NTW

                                         Regression methods to estimate a single row in A with fixed perturbations
                                         回归方法估计固定扰动在一个单一行

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Regression methods to estimate a single row in a gene interaction network (A) with perturbations (P) fixed. These methods differ at the regression criterions: the objective function of geo is the geometric mean, sum of square for sse and maximum likelihood for ml, see vignette for the details.
回归方法估计在（A）与扰动固定（P）的基因相互作用网络单列。这些方法不同，在回归的准则：GEO目标函数的几何平均数，平方和SSE和最大似然毫升，看到细节的小插曲。


用法----------Usage----------


method.geo(index.vars, X, pert)
method.sse(index.vars, X, pert)
method.ml(index.vars, X, pert, noiseLevel)



参数----------Arguments----------

参数：index.vars
A vector to select the rows in X on which regression will be used. It sets a group of combination of rows in X.  
一个向量，选择在X上的回归将用于行。它设置在X组的行组合


参数：X
Gene expression data, a matrix with genes as rows and perturbations as columns.  
基因表达数据，一个矩阵的行和列扰动的基因。


参数：pert
A vector of row r in P.
在体育的行向量ŕ


参数：noiseLevel
Indicate the noise level in each perturbed experiment.
在每个扰动的实验表明，噪音水平。


值----------Value----------


参数： sol
A vector of regression result  
回归结果的向量


参数： error
The result of the objective function.  
目标函数的结果。


作者（S）----------Author(s)----------


Wei Xiao, Yin Jin, Darong Lai, Xinyi Yang,Yuanhua Liu, Christine Nardini

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