combineTechReps(NormqPCR)
combineTechReps()所属R语言包:NormqPCR
Combines Technical Replicates
结合技术复制
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Takes expression set of qPCR values containing technical replicates and combines them.
需要表达的定量PCR技术值包含设置复制,并结合他们。
用法----------Usage----------
combineTechReps(qPCRBatch, ...)
## S4 method for signature 'qPCRBatch'
combineTechReps(qPCRBatch, calc="arith")
参数----------Arguments----------
参数:qPCRBatch
Expression set containing qPCR data, read in by a ReadqPCR function and containing technical reps, denoted by _TechRep.n suffix.
qPCR数据读取,由ReadqPCR功能和含有技术代表,记_TechRep.n后缀表达式设置。
参数:...
Extra arguments, detailed below
额外的参数,下面详细介绍
参数:calc
use median, arithmetic or geometric mean for combining the values
使用相结合的值中位数,算术或几何平均数
Details
详情----------Details----------
Takes exprs of qPCR values containing technical replicates and combines them using a specified centrality measure.
注意到exprs定量PCR技术值包含复制,并结合使用指定的核心措施。
值----------Value----------
qPCRBatch with same number of samples, but with less features, since all technical replicates are replaced with a single value of their means.
qPCRBatch相同数量的样本,但功能少,复制,因为所有的技术与手段的单一值取代。
作者(S)----------Author(s)----------
James Perkins <a href="mailto:jperkins@biochem.ucl.ac.uk">jperkins@biochem.ucl.ac.uk</a>
举例----------Examples----------
path <- system.file("exData", package = "NormqPCR")
qPCR.example.techReps <- file.path(path, "qPCR.techReps.txt")
qPCRBatch.qPCR.techReps <- read.qPCR(qPCR.example.techReps)
rownames(exprs(qPCRBatch.qPCR.techReps))
combinedTechReps <- combineTechReps(qPCRBatch.qPCR.techReps)
rownames(exprs(combinedTechReps))
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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