R语言 NormqPCR包 BladderRepro()函数中文帮助文档(中英文对照)

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BladderRepro(NormqPCR)
BladderRepro()所属R语言包：NormqPCR

                                         Data set of Andersen et al (2004)
                                         安德森等人（2004）数据集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set was used in Andersen et al (2004) to demonstrate normalization  of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of housekeeping genes.
该数据集被用来在安德森等人（2004），展示实时定量RT-PCR看家基因的几何平均数据的标准化。


用法----------Usage----------


data(BladderRepro)



格式----------Format----------

A qPCRBatch object which contains an expression matrix with 28 observations on the following 14 variables which stand for  expression data potential reference/housekeeping genes
一个qPCRBatch对象，其中包含了以下14个变量，站在表达数据的潜在参考/管家基因表达矩阵28意见




Grade Grade of bladder cancer.
Grade级膀胱癌。




Sample.no. sample number.
Sample.no.样本数。




CD14 CD14 molecule.
CD14CD14的分子。




FCN1 Ficolin (collagen/fibrinogen domain containing) 1.
FCN1的Ficolin（含胶原蛋白/纤维蛋白原域）1。




CCNG2 Cyclin G2.
CCNG2单元周期蛋白G2。




NPAS2 Neuronal PAS domain protein 2.
NPAS2神经PAS结构域蛋白2。




UBC Ubiquitin C.
UBC泛素C。




CFL1 Cofilin 1 (non-muscle).
CFL1cofilin的1（非肌肉）。




ACTB Actin, beta.
ACTB肌动蛋白，β。




GAPD Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase.
GAPD甘油醛-3  - 磷酸脱氢酶。

It also contains a "group" column in the pData slot, which gives information on the different sample classes, necessary for the NormFinder algorithm
它还包含一个“组”列在PDATA插槽，提供不同的样品类的信息，为必要的NormFinder算法


Details

详情----------Details----------

This data set was used to check the reproducibility of the results obtained in Andersen et al (2004).
这组数据被用来检查在安德森等人（2004年）所取得的成果的可重复性。


源----------Source----------

The data set was obtained from http://www.mdl.dk/Publications_sup1.htm
数据集从http://www.mdl.dk/Publications_sup1.htm获得的


参考文献----------References----------

Normalization of Real-Time Quantitative Reverse Transcription-PCR Data:  A Model-Based Variance Estimation Approach to Identify Genes Suited for Normalization, Applied to Bladder and Colon Cancer Data Sets.  CANCER RESEARCH 64, 5245-5250, August 1, 2004. http://cancerres.aacrjournals.org/cgi/content/full/64/15/5245

举例----------Examples----------


  data(BladderRepro)
  head(exprs(BladderRepro.qPCRBatch))
  pData(BladderRepro.qPCRBatch)

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