sim.intervention(nem)
sim.intervention()所属R语言包:nem
Simulate interventions in a Nested Effects Model
在嵌套效果模型模拟干预
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Simulates a knock-down of a list of network nodes and returns the network nodes and effect reporters, where effects are expected.
模拟击倒一个网络节点列表,并返回网络节点和效果记者,预计影响。
用法----------Usage----------
sim.intervention(x, int)
参数----------Arguments----------
参数:x
nem object
NEM对象
参数:int
a character vector of nodes in the network
一个网络中的节点的特征向量
值----------Value----------
list with two slots:
列出两个插槽:
参数:Sgenes.effected
effected network nodes
对网络节点
参数:Egenes.effected
effected downstream effect reporters
对下游的影响记者
作者(S)----------Author(s)----------
Holger Froehlich
举例----------Examples----------
data("BoutrosRNAi2002")
D <- BoutrosRNAiDiscrete[,9:16]
res = nem(D, control=set.default.parameters(unique(colnames(D)), para=c(0.13,0.05)))
sim.intervention(res, "rel") # simulate knock-down of rel[模拟敲下来的REL]
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