R语言 NCIgraph包 parseNCInetwork()函数中文帮助文档(中英文对照)

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parseNCInetwork(NCIgraph)
parseNCInetwork()所属R语言包：NCIgraph

                                        Takes a NCI network and transforms it into a simpler graph only
                                         需要NCI的网络，它转换成一个简单的图形

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Takes a NCI network and transforms it into a simpler graph only representing inhibition/activation relationships between genes.
需要NCI的网络，它转换成一个简单的图形只占抑制/激活基因之间的关系。


用法----------Usage----------


parseNCInetwork(g, propagateReg=TRUE, separateEntrez=TRUE, mergeEntrezCopies=TRUE, entrezOnly=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：g
A graph object.
一个graph对象。


参数：propagateReg
A logical. If TRUE, use propagateRegulation to transform the network before parsing it.
Alogical。如果TRUE，使用propagateRegulation改造前解析它的网络。


参数：separateEntrez
A logical. If TRUE, don't merge two nodes with entrezID.
Alogical。如果TRUE，不合并与entrezID的两个节点。


参数：mergeEntrezCopies
A logical. If TRUE, merge resulting nodes that have the same entrezID.
Alogical。如果TRUE，合并产生的节点具有相同的entrezID。


参数：entrezOnly
A logical. If TRUE, only keep nodes with an entrezID property.
Alogical。如果TRUE，只保留节点与entrezID财产。


值----------Value----------

The new graph object.
新的graph对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Laurent Jacob



举例----------Examples----------


## Load NCIgraph[＃加载NCIgraph]

library(NCIgraph)

## Get some raw networks[＃获取一些原始网络。]

data("NCIgraphVignette", package="NCIgraph")

## Parse the first of them[＃解析其中第一]

parsedNetwork <- parseNCInetwork(NCI.demo.cyList[[1]],propagateReg=TRUE,separateEntrez=TRUE,mergeEntrezCopies=TRUE,entrezOnly=TRUE)

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