openMSfile(mzR)
openMSfile()所属R语言包:mzR
Create and check mzR objects from netCDF, mzXML, mzData or mzML files.
NetCDF的,mzXML,mzData或mzML文件的创建和检查MZR对象。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The openMSfile constructor will create a new format-specifc mzR object, open 'filename' file and all header information is loaded as a Rcpp module and made accessible through the ramp slot of the resulting object.
openMSfile构造将创建一个新的格式specifcmzR对象,打开“文件名”文件和所有头信息加载作为Rcpp模块,并通过产生的槽ramp访问对象。
用法----------Usage----------
openMSfile(filename, backend=c("Ramp", "netCDF"), verbose = FALSE)
initializeRamp(object)
isInitialized(object)
fileName(object)
参数----------Arguments----------
参数:filename
Path name of the netCDF, mzData, mzXML or mzML file to read.
NetCDF的,mzData,mzXML或mzML文件读取的路径名。
参数:backend
A character specifiying with backend API to use. Currently only 'Ramp' and 'netCDF' are available. 'pwiz' will be added in future version.
一个character specifiying与后端API使用。目前唯一的“斜坡”和“创建NetCDF”。 pwiz“将在未来版本中添加。
参数:object
An instantiated mzR object.
一个实例的MZR对象。
参数:verbose
Enable verbose output.
启用详细输出。
作者(S)----------Author(s)----------
Steffen Neumann and Laurent Gatto
举例----------Examples----------
library(msdata)
filepath <- system.file("microtofq", package = "msdata")
file <- list.files(filepath, pattern="MM14.mzML",
full.names=TRUE, recursive = TRUE)
mz <- openMSfile(file)
fileName(mz)
isInitialized(mz)
runInfo(mz)
close(mz)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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