mulOptPars(Mulcom)
mulOptPars()所属R语言包:Mulcom
MulCom Parameter Optimization
MulCom参数优化
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to optimize Mulcom parameter for maximim nuber of genes with a user defined FDR
用户定义FDRmaximim基因nuber的功能,优化Mulcom参数
用法----------Usage----------
mulOptPars(opt, ind, ths)
参数----------Arguments----------
参数:opt
an MulCom optimization object
一个MulCom优化目标
参数:ind
index corresponding to the comparison
相应指数的比较
参数:ths
a threshold for the FDR optimization, default is 0.05
为FDR优化的阈值,默认为0.05
Details
详情----------Details----------
mulOptPars MulCom optimization function to identify best parameters
mulOptPars的MulCom优化功能,以找出最佳参数
作者(S)----------Author(s)----------
Claudio Isella, <a href="mailto:claudio.isella@ircc.it">claudio.isella@ircc.it</a>
举例----------Examples----------
data(benchVign)
mulcom_perm <- mulPerm(Affy, Affy$Groups, 10, 7)
#mulcom_opt <- mulOpt(mulcom_perm, seq(0.1, 0.5, 0.1), seq(1, 3, 0.1))[< - mulOpt mulcom_opt(mulcom_perm,SEQ(0.1,0.5,0.1),SEQ(1,3,0.1))]
#optThs <- mulOptPars(mulcom_opt, 1, 0.05)[optThs < - mulOptPars(mulcom_opt,1,0.05)]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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