R语言 MSnbase包 TMT6()函数中文帮助文档(中英文对照)

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TMT6(MSnbase)
TMT6()所属R语言包：MSnbase

                                         TMT 6-plex set
                                         TMT的6丛集

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This instance of class "ReporterIons" corresponds to the TMT 6-plex set, i.e the 126, 127, 128, 129, 130 and 131 isobaric tags. In the TMT7 data set, an unfragmented tag, i.e reporter and attached isobaric tag, is also included at MZ 229. These objects are used to plot the reporter ions of interest in an MSMS spectra (see "Spectrum2") as well as for quantification (see quantify).
这"ReporterIons"类的实例对应于TMT 6复杂的设置，即126，127，128，129，130和131等压标记。在TMT7数据集，不分段标记，即记者和附加等压标记，也包括在锰锌229。这些对象用于绘制在MSMS光谱记者感兴趣的离子（见"Spectrum2"）以及量化（见quantify）。


用法----------Usage----------


TMT6
TMT7



参考文献----------References----------

Neumann T, Johnstone R, Mohammed AK, Hamon C. "Tandem mass tags: a novel quantification strategy for comparative analysis of complex protein mixtures by MS/MS." Anal Chem. 2003 Apr 15;75(8):1895-904. Erratum in: Anal Chem. 2006 Jun 15;78(12):4235. Mohammed, A Karim A [added] and   Anal Chem. 2003 Sep 15;75(18):4942. Johnstone, R [added]. PubMed PMID: 12713048.

参见----------See Also----------

iTRAQ4.
iTRAQ4。


举例----------Examples----------


TMT6
TMT6[1:2]

newReporter <- new("ReporterIons",
                   description="an example",
                   name="my reporter ions",
                   reporterNames=c("myrep1","myrep2"),
                   mz=c(121,122),
                   col=c("red","blue"),
                   width=0.05)
newReporter

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