getGademPWM(MotIV)
getGademPWM()所属R语言包:MotIV
Recover PWM
恢复的PWM
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function selects the PWMs contained in an object of type gadem.
此功能选择一个对象类型gadem中的PWM。
用法----------Usage----------
getGademPWM(y)
参数----------Arguments----------
参数:y
A gadem object.
一个gadem对象。
值----------Value----------
A list of PWM.
PWM的名单。
作者(S)----------Author(s)----------
Eloi Mercier <<a href="mailto:emercier@chibi.ubc.ca">emercier@chibi.ubc.ca</a>>
举例----------Examples----------
#####Database and Scores#####[####数据库和成绩#####]
path <- system.file(package="MotIV")
jaspar <- readPWMfile(paste(path,"/extdata/jaspar2010.txt",sep=""))
jaspar.scores <- readDBScores(paste(path,"/extdata/jaspar2010_PCC_SWU.scores",sep=""))
#####Input#####[####输入#####]
data(FOXA1_rGADEM)
# motifs <- getGademPWM(gadem) #depreciated[图案< - #贬值getGademPWM(gadem)]
motifs <- getPWM(gadem)
motifs.trimed <- trimPWMedge(motifs, threshold=1)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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