R语言 minfi包 densityPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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densityPlot(minfi)
densityPlot()所属R语言包：minfi

                                         Density plots of methylation Beta values.
                                         甲基化的β值的密度图。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Density plots of methylation Beta values, primarily for QC.
密度图，甲基化的β值，主要用于质量控制。


用法----------Usage----------


densityPlot(dat, sampGroups = NULL, main = "", xlab = "Beta",
    pal = brewer.pal(8, "Dark2"), xlim, ylim, add = TRUE, legend = TRUE,
    ...)



参数----------Arguments----------

参数：dat
An RGChannelSet, a MethylSet or a matrix.  We either use the getBeta function to get Beta values (for the first two) or we assume the matrix contains Beta values.
RGChannelSet，MethylSet或matrix。我们要么使用getBeta函数得到的Beta值（前两个），我们假设矩阵含有β值。


参数：sampGroups
Optional sample group labels. See details.
可选样本组的标签。查看详情。


参数：main
Plot title.
图称号。


参数：xlab
x-axis label.
X轴标签。


参数：pal
Color palette.
调色板。


参数：xlim
x-axis limits.
X-轴的限制。


参数：ylim
y-axis limits.
y轴的限制。


参数：add
Start a new plot?
启动一个新的图？


参数：legend
Plot legend.
图例。


参数：...
Additional options to be passed to the plot command.
要传递给plot命令的附加选项。


Details

详情----------Details----------

This function produces the density plot component of the QC report. If sampGroups is specified, group-specific colors will be used.
此功能密度积组件生产的QC报告。如果sampGroups指定，特定组的颜色将被使用。


值----------Value----------

No return value. Plots are produced as a side-effect.
没有返回值。图是作为一个副作用。


作者（S）----------Author(s)----------



Martin Aryee <a href="mailto:aryee@jhu.edu">aryee@jhu.edu</a>.




参见----------See Also----------

qcReport, mdsPlot, controlStripPlot, densityBeanPlot
qcReport，mdsPlot，controlStripPlot，densityBeanPlot


举例----------Examples----------


if (require(minfiData)) {

groups <- pData(RGsetEx)$Sample_Group
densityPlot(RGsetEx, sampGroups=groups)

}

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