找回密码
 注册
查看: 722|回复: 0

R语言 Mfuzz包 mfuzz.plot()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-2-26 00:48:21 | 显示全部楼层 |阅读模式
mfuzz.plot(Mfuzz)
mfuzz.plot()所属R语言包:Mfuzz

                                        Plotting results for soft clustering
                                         绘图软聚类结果

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function visualises the clusters
此功能形象化聚类


用法----------Usage----------


mfuzz.plot(eset,cl,mfrow=c(1,1),colo,min.mem=0,time.labels,new.window=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:eset
object of the classExpressionSet.
对象的classExpressionSet。


参数:cl
object of class flclust.
对象类flclust。


参数:mfrow
determines splitting of graphic window.
确定图形窗口的分裂。


参数:colo
color palette to be used for plotting. If the color argument remains empty, the default palette is used.
调色板可用于绘制。如果颜色参数仍然是空的,默认的调色板使用。


参数:min.mem
Genes with membership values below min.mem will not be displayed.
下面min.mem成员值的基因不会被显示出来。


参数:time.labels
labels can be given for the time axis.
标签可以给定的时间轴线。


参数:new.window
should a new window be opened for graphics.
要打开一个新的窗口图形。


值----------Value----------

The function generates plots where the membership of genes
函数生成图基因的成员


作者(S)----------Author(s)----------


Matthias E. Futschik  (<a href="http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik">http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik</a>)



举例----------Examples----------


if (interactive()){
data(yeast)
# Data pre-processing[数据预处理]
yeastF <- filter.NA(yeast)
yeastF <- fill.NA(yeastF)
yeastF <- standardise(yeastF)

# Soft clustering and visualisation[软聚类和可视化]
cl <- mfuzz(yeastF,c=20,m=1.25)
mfuzz.plot(yeastF,cl=cl,mfrow=c(2,2))

# display of cluster cores with alpha = 0.5[显示聚类核心与α= 0.5]
mfuzz.plot(yeastF,cl=cl,mfrow=c(2,2),min.mem=0.5)

# display of cluster cores with alpha = 0.7[显示聚类核心与α= 0.7]
mfuzz.plot(yeastF,cl=cl,mfrow=c(2,2),min.mem=0.7)
}

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2025-2-3 18:55 , Processed in 0.024338 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表