cselection(Mfuzz)
cselection()所属R语言包：Mfuzz
Repeated soft clustering for detection of empty clusters
重复检测空聚类的软聚类
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function performs repeated soft clustering for a range of cluster numbers c and reports the number of empty clusters
执行此功能重复的软聚类簇数Ç范围为报告空聚类
用法----------Usage----------
cselection(eset,m,crange=seq(4,32,4),repeats=5,visu=TRUE,...)
参数----------Arguments----------
参数：eset
object of class ExpressionSet.
对象类ExpressionSet。
参数：m
value of fuzzy c-means parameter m.
模糊C-均值参数m价值。
参数：crange
range of number of clusters c.
范围聚类c。
参数：repeats
number of repeated clusterings.
重复聚类数目。
参数：visu
If visu=TRUE plot of number of empty clusters is produced.
如果visu=TRUE空聚类数量的图产生。
参数：...
additional arguments for underlying mfuzz.
基本mfuzz额外的参数。
Details
详情----------Details----------
A soft cluster is considered as empty, if none of the genes
软聚类被认为是空的，如果没有的基因
值----------Value----------
A matrix with the number of empty clusters detected is
检测到的是一个空聚类矩阵
注意----------Note----------
The cselection function may help to determine an accurate cluster number. However, it should be used with care, as the determination remains difficult especially for short time series and overlapping clusters. A better way is likely to perform clustering with a range of cluster numbers and subsequently assess their biological relevance e.g. by GO analyses.
cselection功能，可以帮助确定一个准确的簇号。然而，应谨慎使用，决心仍然困难，特别是短的时间序列和重叠聚类。一个更好的办法可能是执行聚类簇数的范围，并随后评估其生物相关，如由GO分析。
作者（S）----------Author(s)----------
Matthias E. Futschik (<a href="http://www.cbme.ualg.pt/mfutschik_cbme.html">http://www.cbme.ualg.pt/mfutschik_cbme.html</a>)
参考文献----------References----------
gene expression time-course data, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 3 (4), 965-988, 2005
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
|
发表于 2012-2-26 00:47:33
